Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A3GALT2U3KPV4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
A3GALT2U3KPV4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
A3GALT2U3KPV4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
A3GALT2U3KPV4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
A3GALT2U3KPV4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
A3GALT2U3KPV4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A3GALT2U3KPV4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
A3GALT2U3KPV4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
A3GALT2U3KPV4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
A3GALT2U3KPV4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
A3GALT2U3KPV4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A3GALT2U3KPV4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A3GALT2U3KPV4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A3GALT2U3KPV4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A3GALT2U3KPV4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A3GALT2U3KPV4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A3GALT2U3KPV4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A3GALT2U3KPV4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A3GALT2U3KPV4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A3GALT2U3KPV4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A3GALT2U3KPV4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
A3GALT2U3KPV4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A3GALT2U3KPV4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A3GALT2U3KPV4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A3GALT2U3KPV4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A3GALT2U3KPV4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A3GALT2U3KPV4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A3GALT2U3KPV4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A3GALT2U3KPV4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A3GALT2U3KPV4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A3GALT2U3KPV4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
A3GALT2U3KPV4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
A3GALT2U3KPV4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
A3GALT2U3KPV4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
A3GALT2U3KPV4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
A3GALT2U3KPV4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
A3GALT2U3KPV4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
A3GALT2U3KPV4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
A3GALT2U3KPV4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
A3GALT2U3KPV4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
A3GALT2U3KPV4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A3GALT2U3KPV4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
A3GALT2U3KPV4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A3GALT2U3KPV4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A3GALT2U3KPV4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A3GALT2U3KPV4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
A3GALT2U3KPV4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A3GALT2U3KPV4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
A3GALT2U3KPV4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
A3GALT2U3KPV4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A3GALT2U3KPV4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
A3GALT2U3KPV4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
A3GALT2U3KPV4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
A3GALT2U3KPV4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A3GALT2U3KPV4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
A3GALT2U3KPV4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
A3GALT2U3KPV4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
A3GALT2U3KPV4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
A3GALT2U3KPV4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
A3GALT2U3KPV4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
A3GALT2U3KPV4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
A3GALT2U3KPV4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A3GALT2U3KPV4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
A3GALT2U3KPV4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A3GALT2U3KPV4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
A3GALT2U3KPV4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A3GALT2U3KPV4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
A3GALT2U3KPV4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
A3GALT2U3KPV4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
A3GALT2U3KPV4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A3GALT2U3KPV4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
A3GALT2U3KPV4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A3GALT2U3KPV4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
A3GALT2U3KPV4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A3GALT2U3KPV4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
A3GALT2U3KPV4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A3GALT2U3KPV4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A3GALT2U3KPV4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
A3GALT2U3KPV4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A3GALT2U3KPV4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A3GALT2U3KPV4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A3GALT2U3KPV4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A3GALT2U3KPV4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A3GALT2U3KPV4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A3GALT2U3KPV4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A3GALT2U3KPV4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A3GALT2U3KPV4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A3GALT2U3KPV4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A3GALT2U3KPV4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A3GALT2U3KPV4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A3GALT2U3KPV4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A3GALT2U3KPV4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A3GALT2U3KPV4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A3GALT2U3KPV4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A3GALT2U3KPV4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A3GALT2U3KPV4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A3GALT2U3KPV4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A3GALT2U3KPV4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A3GALT2U3KPV4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms