Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARFGEF2Q9Y6D5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ARFGEF2Q9Y6D5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ARFGEF2Q9Y6D5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
ARFGEF2Q9Y6D5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ARFGEF2Q9Y6D5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARFGEF2Q9Y6D5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
ARFGEF2Q9Y6D5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ARFGEF2Q9Y6D5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
ARFGEF2Q9Y6D5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
ARFGEF2Q9Y6D5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
ARFGEF2Q9Y6D5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARFGEF2Q9Y6D5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARFGEF2Q9Y6D5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ARFGEF2Q9Y6D5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ARFGEF2Q9Y6D5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ARFGEF2Q9Y6D5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ARFGEF2Q9Y6D5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARFGEF2Q9Y6D5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ARFGEF2Q9Y6D5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
ARFGEF2Q9Y6D5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ARFGEF2Q9Y6D5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARFGEF2Q9Y6D5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ARFGEF2Q9Y6D5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ARFGEF2Q9Y6D5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
ARFGEF2Q9Y6D5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ARFGEF2Q9Y6D5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
ARFGEF2Q9Y6D5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARFGEF2Q9Y6D5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ARFGEF2Q9Y6D5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
ARFGEF2Q9Y6D5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARFGEF2Q9Y6D5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARFGEF2Q9Y6D5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ARFGEF2Q9Y6D5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ARFGEF2Q9Y6D5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ARFGEF2Q9Y6D5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARFGEF2Q9Y6D5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
ARFGEF2Q9Y6D5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARFGEF2Q9Y6D5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ARFGEF2Q9Y6D5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARFGEF2Q9Y6D5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
ARFGEF2Q9Y6D5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARFGEF2Q9Y6D5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARFGEF2Q9Y6D5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARFGEF2Q9Y6D5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARFGEF2Q9Y6D5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARFGEF2Q9Y6D5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARFGEF2Q9Y6D5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARFGEF2Q9Y6D5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARFGEF2Q9Y6D5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARFGEF2Q9Y6D5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARFGEF2Q9Y6D5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARFGEF2Q9Y6D5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARFGEF2Q9Y6D5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARFGEF2Q9Y6D5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ARFGEF2Q9Y6D5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
ARFGEF2Q9Y6D5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARFGEF2Q9Y6D5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARFGEF2Q9Y6D5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARFGEF2Q9Y6D5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ARFGEF2Q9Y6D5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARFGEF2Q9Y6D5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARFGEF2Q9Y6D5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARFGEF2Q9Y6D5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARFGEF2Q9Y6D5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ARFGEF2Q9Y6D5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ARFGEF2Q9Y6D5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
ARFGEF2Q9Y6D5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
ARFGEF2Q9Y6D5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ARFGEF2Q9Y6D5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
ARFGEF2Q9Y6D5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
ARFGEF2Q9Y6D5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARFGEF2Q9Y6D5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ARFGEF2Q9Y6D5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
ARFGEF2Q9Y6D5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ARFGEF2Q9Y6D5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARFGEF2Q9Y6D5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ARFGEF2Q9Y6D5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARFGEF2Q9Y6D5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
ARFGEF2Q9Y6D5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ARFGEF2Q9Y6D5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ARFGEF2Q9Y6D5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ARFGEF2Q9Y6D5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
ARFGEF2Q9Y6D5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms