Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSSC4Q9Y5U2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TSSC4Q9Y5U2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSSC4Q9Y5U2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TSSC4Q9Y5U2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TSSC4Q9Y5U2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TSSC4Q9Y5U2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSC4Q9Y5U2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TSSC4Q9Y5U2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSC4Q9Y5U2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSC4Q9Y5U2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TSSC4Q9Y5U2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TSSC4Q9Y5U2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSC4Q9Y5U2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TSSC4Q9Y5U2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TSSC4Q9Y5U2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSSC4Q9Y5U2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TSSC4Q9Y5U2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TSSC4Q9Y5U2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TSSC4Q9Y5U2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSC4Q9Y5U2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSC4Q9Y5U2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TSSC4Q9Y5U2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSC4Q9Y5U2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSSC4Q9Y5U2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSSC4Q9Y5U2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSSC4Q9Y5U2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSC4Q9Y5U2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSC4Q9Y5U2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSSC4Q9Y5U2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSC4Q9Y5U2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSC4Q9Y5U2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSSC4Q9Y5U2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSC4Q9Y5U2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSSC4Q9Y5U2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSSC4Q9Y5U2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TSSC4Q9Y5U2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSSC4Q9Y5U2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TSSC4Q9Y5U2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSSC4Q9Y5U2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TSSC4Q9Y5U2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TSSC4Q9Y5U2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TSSC4Q9Y5U2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSSC4Q9Y5U2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TSSC4Q9Y5U2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSSC4Q9Y5U2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TSSC4Q9Y5U2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TSSC4Q9Y5U2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TSSC4Q9Y5U2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TSSC4Q9Y5U2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSC4Q9Y5U2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TSSC4Q9Y5U2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSSC4Q9Y5U2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSC4Q9Y5U2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TSSC4Q9Y5U2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSSC4Q9Y5U2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TSSC4Q9Y5U2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSC4Q9Y5U2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSC4Q9Y5U2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSSC4Q9Y5U2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TSSC4Q9Y5U2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TSSC4Q9Y5U2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TSSC4Q9Y5U2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TSSC4Q9Y5U2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TSSC4Q9Y5U2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TSSC4Q9Y5U2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSC4Q9Y5U2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSC4Q9Y5U2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TSSC4Q9Y5U2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSC4Q9Y5U2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TSSC4Q9Y5U2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSC4Q9Y5U2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TSSC4Q9Y5U2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TSSC4Q9Y5U2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSC4Q9Y5U2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSC4Q9Y5U2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TSSC4Q9Y5U2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSC4Q9Y5U2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSC4Q9Y5U2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSC4Q9Y5U2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TSSC4Q9Y5U2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TSSC4Q9Y5U2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSC4Q9Y5U2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TSSC4Q9Y5U2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSSC4Q9Y5U2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSSC4Q9Y5U2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TSSC4Q9Y5U2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TSSC4Q9Y5U2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TSSC4Q9Y5U2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSSC4Q9Y5U2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSC4Q9Y5U2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSSC4Q9Y5U2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TSSC4Q9Y5U2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSSC4Q9Y5U2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSSC4Q9Y5U2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSSC4Q9Y5U2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSSC4Q9Y5U2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSSC4Q9Y5U2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSSC4Q9Y5U2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TSSC4Q9Y5U2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms