Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G2

PCDHGB2, Protocadherin gamma-B2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB2Q9Y5G2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHGB2Q9Y5G2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHGB2Q9Y5G2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHGB2Q9Y5G2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHGB2Q9Y5G2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHGB2Q9Y5G2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHGB2Q9Y5G2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHGB2Q9Y5G2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHGB2Q9Y5G2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHGB2Q9Y5G2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHGB2Q9Y5G2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHGB2Q9Y5G2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHGB2Q9Y5G2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHGB2Q9Y5G2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PCDHGB2Q9Y5G2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHGB2Q9Y5G2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHGB2Q9Y5G2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHGB2Q9Y5G2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHGB2Q9Y5G2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHGB2Q9Y5G2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHGB2Q9Y5G2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHGB2Q9Y5G2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHGB2Q9Y5G2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHGB2Q9Y5G2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PCDHGB2Q9Y5G2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHGB2Q9Y5G2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PCDHGB2Q9Y5G2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHGB2Q9Y5G2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHGB2Q9Y5G2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHGB2Q9Y5G2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PCDHGB2Q9Y5G2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHGB2Q9Y5G2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHGB2Q9Y5G2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCDHGB2Q9Y5G2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHGB2Q9Y5G2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHGB2Q9Y5G2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCDHGB2Q9Y5G2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHGB2Q9Y5G2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCDHGB2Q9Y5G2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCDHGB2Q9Y5G2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHGB2Q9Y5G2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCDHGB2Q9Y5G2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PCDHGB2Q9Y5G2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCDHGB2Q9Y5G2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHGB2Q9Y5G2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHGB2Q9Y5G2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHGB2Q9Y5G2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PCDHGB2Q9Y5G2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCDHGB2Q9Y5G2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCDHGB2Q9Y5G2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PCDHGB2Q9Y5G2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHGB2Q9Y5G2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCDHGB2Q9Y5G2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHGB2Q9Y5G2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PCDHGB2Q9Y5G2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHGB2Q9Y5G2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHGB2Q9Y5G2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PCDHGB2Q9Y5G2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHGB2Q9Y5G2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHGB2Q9Y5G2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHGB2Q9Y5G2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHGB2Q9Y5G2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHGB2Q9Y5G2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHGB2Q9Y5G2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHGB2Q9Y5G2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHGB2Q9Y5G2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCDHGB2Q9Y5G2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHGB2Q9Y5G2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHGB2Q9Y5G2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHGB2Q9Y5G2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHGB2Q9Y5G2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHGB2Q9Y5G2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHGB2Q9Y5G2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHGB2Q9Y5G2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHGB2Q9Y5G2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHGB2Q9Y5G2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHGB2Q9Y5G2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHGB2Q9Y5G2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHGB2Q9Y5G2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHGB2Q9Y5G2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHGB2Q9Y5G2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHGB2Q9Y5G2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHGB2Q9Y5G2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHGB2Q9Y5G2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHGB2Q9Y5G2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHGB2Q9Y5G2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHGB2Q9Y5G2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHGB2Q9Y5G2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHGB2Q9Y5G2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHGB2Q9Y5G2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHGB2Q9Y5G2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHGB2Q9Y5G2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHGB2Q9Y5G2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHGB2Q9Y5G2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms