Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y547

HSPB11, Intraflagellar transport protein 25 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB11Q9Y547 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPB11Q9Y547 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPB11Q9Y547 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSPB11Q9Y547 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSPB11Q9Y547 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSPB11Q9Y547 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HSPB11Q9Y547 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSPB11Q9Y547 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSPB11Q9Y547 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSPB11Q9Y547 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSPB11Q9Y547 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HSPB11Q9Y547 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSPB11Q9Y547 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSPB11Q9Y547 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSPB11Q9Y547 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSPB11Q9Y547 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSPB11Q9Y547 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSPB11Q9Y547 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSPB11Q9Y547 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSPB11Q9Y547 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSPB11Q9Y547 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSPB11Q9Y547 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSPB11Q9Y547 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPB11Q9Y547 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPB11Q9Y547 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPB11Q9Y547 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSPB11Q9Y547 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPB11Q9Y547 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HSPB11Q9Y547 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPB11Q9Y547 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPB11Q9Y547 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPB11Q9Y547 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB11Q9Y547 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB11Q9Y547 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSPB11Q9Y547 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPB11Q9Y547 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPB11Q9Y547 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPB11Q9Y547 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPB11Q9Y547 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPB11Q9Y547 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPB11Q9Y547 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPB11Q9Y547 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPB11Q9Y547 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPB11Q9Y547 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPB11Q9Y547 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPB11Q9Y547 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPB11Q9Y547 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSPB11Q9Y547 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSPB11Q9Y547 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPB11Q9Y547 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPB11Q9Y547 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPB11Q9Y547 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPB11Q9Y547 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPB11Q9Y547 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPB11Q9Y547 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPB11Q9Y547 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HSPB11Q9Y547 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPB11Q9Y547 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPB11Q9Y547 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPB11Q9Y547 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPB11Q9Y547 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPB11Q9Y547 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPB11Q9Y547 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPB11Q9Y547 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPB11Q9Y547 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPB11Q9Y547 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPB11Q9Y547 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPB11Q9Y547 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPB11Q9Y547 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPB11Q9Y547 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPB11Q9Y547 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPB11Q9Y547 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPB11Q9Y547 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB11Q9Y547 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPB11Q9Y547 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPB11Q9Y547 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPB11Q9Y547 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPB11Q9Y547 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPB11Q9Y547 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPB11Q9Y547 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPB11Q9Y547 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPB11Q9Y547 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPB11Q9Y547 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPB11Q9Y547 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPB11Q9Y547 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPB11Q9Y547 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPB11Q9Y547 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPB11Q9Y547 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HSPB11Q9Y547 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSPB11Q9Y547 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSPB11Q9Y547 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSPB11Q9Y547 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSPB11Q9Y547 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSPB11Q9Y547 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPB11Q9Y547 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPB11Q9Y547 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPB11Q9Y547 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSPB11Q9Y547 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPB11Q9Y547 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPB11Q9Y547 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms