Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRELID3BQ9Y3B1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRELID3BQ9Y3B1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRELID3BQ9Y3B1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRELID3BQ9Y3B1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRELID3BQ9Y3B1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRELID3BQ9Y3B1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRELID3BQ9Y3B1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRELID3BQ9Y3B1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRELID3BQ9Y3B1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRELID3BQ9Y3B1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRELID3BQ9Y3B1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRELID3BQ9Y3B1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRELID3BQ9Y3B1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRELID3BQ9Y3B1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRELID3BQ9Y3B1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRELID3BQ9Y3B1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRELID3BQ9Y3B1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRELID3BQ9Y3B1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRELID3BQ9Y3B1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRELID3BQ9Y3B1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRELID3BQ9Y3B1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRELID3BQ9Y3B1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRELID3BQ9Y3B1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRELID3BQ9Y3B1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRELID3BQ9Y3B1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRELID3BQ9Y3B1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRELID3BQ9Y3B1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRELID3BQ9Y3B1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRELID3BQ9Y3B1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRELID3BQ9Y3B1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRELID3BQ9Y3B1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRELID3BQ9Y3B1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRELID3BQ9Y3B1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRELID3BQ9Y3B1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRELID3BQ9Y3B1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRELID3BQ9Y3B1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRELID3BQ9Y3B1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRELID3BQ9Y3B1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRELID3BQ9Y3B1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRELID3BQ9Y3B1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRELID3BQ9Y3B1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRELID3BQ9Y3B1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRELID3BQ9Y3B1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRELID3BQ9Y3B1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRELID3BQ9Y3B1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRELID3BQ9Y3B1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRELID3BQ9Y3B1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRELID3BQ9Y3B1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRELID3BQ9Y3B1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRELID3BQ9Y3B1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRELID3BQ9Y3B1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRELID3BQ9Y3B1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRELID3BQ9Y3B1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRELID3BQ9Y3B1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRELID3BQ9Y3B1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRELID3BQ9Y3B1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRELID3BQ9Y3B1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRELID3BQ9Y3B1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRELID3BQ9Y3B1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRELID3BQ9Y3B1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRELID3BQ9Y3B1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRELID3BQ9Y3B1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRELID3BQ9Y3B1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRELID3BQ9Y3B1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRELID3BQ9Y3B1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRELID3BQ9Y3B1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRELID3BQ9Y3B1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRELID3BQ9Y3B1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRELID3BQ9Y3B1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRELID3BQ9Y3B1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRELID3BQ9Y3B1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRELID3BQ9Y3B1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRELID3BQ9Y3B1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRELID3BQ9Y3B1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRELID3BQ9Y3B1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRELID3BQ9Y3B1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRELID3BQ9Y3B1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRELID3BQ9Y3B1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRELID3BQ9Y3B1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRELID3BQ9Y3B1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRELID3BQ9Y3B1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRELID3BQ9Y3B1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRELID3BQ9Y3B1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRELID3BQ9Y3B1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRELID3BQ9Y3B1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRELID3BQ9Y3B1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRELID3BQ9Y3B1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRELID3BQ9Y3B1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRELID3BQ9Y3B1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRELID3BQ9Y3B1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRELID3BQ9Y3B1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRELID3BQ9Y3B1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRELID3BQ9Y3B1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms