Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RNF6Q9Y252 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RNF6Q9Y252 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF6Q9Y252 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RNF6Q9Y252 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RNF6Q9Y252 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF6Q9Y252 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF6Q9Y252 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF6Q9Y252 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RNF6Q9Y252 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF6Q9Y252 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNF6Q9Y252 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNF6Q9Y252 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF6Q9Y252 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNF6Q9Y252 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF6Q9Y252 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF6Q9Y252 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF6Q9Y252 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNF6Q9Y252 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF6Q9Y252 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF6Q9Y252 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNF6Q9Y252 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNF6Q9Y252 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF6Q9Y252 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNF6Q9Y252 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF6Q9Y252 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNF6Q9Y252 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RNF6Q9Y252 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF6Q9Y252 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNF6Q9Y252 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF6Q9Y252 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF6Q9Y252 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNF6Q9Y252 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNF6Q9Y252 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF6Q9Y252 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNF6Q9Y252 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNF6Q9Y252 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNF6Q9Y252 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNF6Q9Y252 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNF6Q9Y252 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RNF6Q9Y252 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF6Q9Y252 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RNF6Q9Y252 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RNF6Q9Y252 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RNF6Q9Y252 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF6Q9Y252 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RNF6Q9Y252 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RNF6Q9Y252 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF6Q9Y252 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RNF6Q9Y252 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF6Q9Y252 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF6Q9Y252 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RNF6Q9Y252 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RNF6Q9Y252 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF6Q9Y252 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF6Q9Y252 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RNF6Q9Y252 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF6Q9Y252 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RNF6Q9Y252 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RNF6Q9Y252 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RNF6Q9Y252 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RNF6Q9Y252 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF6Q9Y252 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF6Q9Y252 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RNF6Q9Y252 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RNF6Q9Y252 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF6Q9Y252 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RNF6Q9Y252 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF6Q9Y252 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RNF6Q9Y252 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF6Q9Y252 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RNF6Q9Y252 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF6Q9Y252 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF6Q9Y252 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF6Q9Y252 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF6Q9Y252 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF6Q9Y252 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF6Q9Y252 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF6Q9Y252 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF6Q9Y252 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF6Q9Y252 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF6Q9Y252 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF6Q9Y252 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF6Q9Y252 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF6Q9Y252 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF6Q9Y252 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF6Q9Y252 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF6Q9Y252 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF6Q9Y252 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF6Q9Y252 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF6Q9Y252 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF6Q9Y252 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF6Q9Y252 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF6Q9Y252 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF6Q9Y252 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF6Q9Y252 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF6Q9Y252 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF6Q9Y252 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF6Q9Y252 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF6Q9Y252 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms