Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
SHANK2Q9UPX8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SHANK2Q9UPX8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
SHANK2Q9UPX8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
SHANK2Q9UPX8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
SHANK2Q9UPX8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
SHANK2Q9UPX8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC42.38■■■■■ 4.37
SHANK2Q9UPX8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SHANK2Q9UPX8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SHANK2Q9UPX8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
SHANK2Q9UPX8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
SHANK2Q9UPX8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
SHANK2Q9UPX8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
SHANK2Q9UPX8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
SHANK2Q9UPX8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
SHANK2Q9UPX8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
SHANK2Q9UPX8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
SHANK2Q9UPX8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
SHANK2Q9UPX8 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
SHANK2Q9UPX8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.22■■■■■ 4.35
SHANK2Q9UPX8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SHANK2Q9UPX8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SHANK2Q9UPX8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
SHANK2Q9UPX8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SHANK2Q9UPX8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
SHANK2Q9UPX8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.34
SHANK2Q9UPX8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SHANK2Q9UPX8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SHANK2Q9UPX8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
SHANK2Q9UPX8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC42.08■■■■■ 4.33
SHANK2Q9UPX8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
SHANK2Q9UPX8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC42.04■■■■■ 4.32
SHANK2Q9UPX8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SHANK2Q9UPX8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
SHANK2Q9UPX8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.99■■■■■ 4.31
SHANK2Q9UPX8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
SHANK2Q9UPX8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
SHANK2Q9UPX8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
SHANK2Q9UPX8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
SHANK2Q9UPX8 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
SHANK2Q9UPX8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
SHANK2Q9UPX8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
SHANK2Q9UPX8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
SHANK2Q9UPX8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SHANK2Q9UPX8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
SHANK2Q9UPX8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
SHANK2Q9UPX8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
SHANK2Q9UPX8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.87■■■■■ 4.29
SHANK2Q9UPX8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
SHANK2Q9UPX8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
SHANK2Q9UPX8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
SHANK2Q9UPX8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.78■■■■■ 4.28
SHANK2Q9UPX8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
SHANK2Q9UPX8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
SHANK2Q9UPX8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
SHANK2Q9UPX8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
SHANK2Q9UPX8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
SHANK2Q9UPX8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
SHANK2Q9UPX8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
SHANK2Q9UPX8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
SHANK2Q9UPX8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
SHANK2Q9UPX8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SHANK2Q9UPX8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
SHANK2Q9UPX8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
SHANK2Q9UPX8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
SHANK2Q9UPX8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SHANK2Q9UPX8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SHANK2Q9UPX8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SHANK2Q9UPX8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
SHANK2Q9UPX8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
SHANK2Q9UPX8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SHANK2Q9UPX8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SHANK2Q9UPX8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
SHANK2Q9UPX8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
SHANK2Q9UPX8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
SHANK2Q9UPX8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
SHANK2Q9UPX8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
SHANK2Q9UPX8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
SHANK2Q9UPX8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
SHANK2Q9UPX8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
SHANK2Q9UPX8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
SHANK2Q9UPX8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
SHANK2Q9UPX8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
SHANK2Q9UPX8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
SHANK2Q9UPX8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.47■■■■■ 4.23
SHANK2Q9UPX8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
SHANK2Q9UPX8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
SHANK2Q9UPX8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
SHANK2Q9UPX8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
SHANK2Q9UPX8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
SHANK2Q9UPX8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
SHANK2Q9UPX8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
SHANK2Q9UPX8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
SHANK2Q9UPX8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
SHANK2Q9UPX8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
SHANK2Q9UPX8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
SHANK2Q9UPX8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
SHANK2Q9UPX8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
SHANK2Q9UPX8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
SHANK2Q9UPX8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms