Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX7Q9UNH6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX7Q9UNH6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX7Q9UNH6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX7Q9UNH6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX7Q9UNH6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX7Q9UNH6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX7Q9UNH6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX7Q9UNH6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX7Q9UNH6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX7Q9UNH6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX7Q9UNH6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX7Q9UNH6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX7Q9UNH6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX7Q9UNH6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX7Q9UNH6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX7Q9UNH6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SNX7Q9UNH6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX7Q9UNH6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SNX7Q9UNH6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX7Q9UNH6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX7Q9UNH6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX7Q9UNH6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX7Q9UNH6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX7Q9UNH6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX7Q9UNH6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX7Q9UNH6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX7Q9UNH6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX7Q9UNH6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX7Q9UNH6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX7Q9UNH6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX7Q9UNH6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX7Q9UNH6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX7Q9UNH6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX7Q9UNH6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX7Q9UNH6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX7Q9UNH6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX7Q9UNH6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX7Q9UNH6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX7Q9UNH6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX7Q9UNH6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX7Q9UNH6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SNX7Q9UNH6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX7Q9UNH6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX7Q9UNH6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX7Q9UNH6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX7Q9UNH6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX7Q9UNH6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX7Q9UNH6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX7Q9UNH6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX7Q9UNH6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX7Q9UNH6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX7Q9UNH6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX7Q9UNH6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX7Q9UNH6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX7Q9UNH6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX7Q9UNH6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX7Q9UNH6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX7Q9UNH6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX7Q9UNH6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX7Q9UNH6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX7Q9UNH6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX7Q9UNH6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX7Q9UNH6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX7Q9UNH6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX7Q9UNH6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX7Q9UNH6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX7Q9UNH6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX7Q9UNH6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX7Q9UNH6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX7Q9UNH6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX7Q9UNH6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX7Q9UNH6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX7Q9UNH6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX7Q9UNH6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX7Q9UNH6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX7Q9UNH6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX7Q9UNH6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX7Q9UNH6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX7Q9UNH6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX7Q9UNH6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX7Q9UNH6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX7Q9UNH6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX7Q9UNH6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX7Q9UNH6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX7Q9UNH6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX7Q9UNH6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX7Q9UNH6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX7Q9UNH6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX7Q9UNH6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX7Q9UNH6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX7Q9UNH6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX7Q9UNH6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX7Q9UNH6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX7Q9UNH6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX7Q9UNH6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX7Q9UNH6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX7Q9UNH6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX7Q9UNH6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX7Q9UNH6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.6 ms