Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMX5

NENF, Neudesin, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENFQ9UMX5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NENFQ9UMX5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NENFQ9UMX5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NENFQ9UMX5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NENFQ9UMX5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NENFQ9UMX5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NENFQ9UMX5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NENFQ9UMX5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NENFQ9UMX5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NENFQ9UMX5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NENFQ9UMX5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NENFQ9UMX5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NENFQ9UMX5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NENFQ9UMX5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NENFQ9UMX5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NENFQ9UMX5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NENFQ9UMX5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NENFQ9UMX5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NENFQ9UMX5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NENFQ9UMX5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NENFQ9UMX5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NENFQ9UMX5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NENFQ9UMX5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NENFQ9UMX5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NENFQ9UMX5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NENFQ9UMX5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
NENFQ9UMX5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NENFQ9UMX5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NENFQ9UMX5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NENFQ9UMX5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NENFQ9UMX5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NENFQ9UMX5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NENFQ9UMX5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NENFQ9UMX5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NENFQ9UMX5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NENFQ9UMX5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NENFQ9UMX5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NENFQ9UMX5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NENFQ9UMX5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NENFQ9UMX5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NENFQ9UMX5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NENFQ9UMX5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NENFQ9UMX5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NENFQ9UMX5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NENFQ9UMX5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NENFQ9UMX5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NENFQ9UMX5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NENFQ9UMX5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NENFQ9UMX5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NENFQ9UMX5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NENFQ9UMX5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NENFQ9UMX5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NENFQ9UMX5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NENFQ9UMX5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NENFQ9UMX5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NENFQ9UMX5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NENFQ9UMX5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NENFQ9UMX5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NENFQ9UMX5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NENFQ9UMX5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
NENFQ9UMX5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NENFQ9UMX5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NENFQ9UMX5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NENFQ9UMX5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NENFQ9UMX5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NENFQ9UMX5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NENFQ9UMX5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NENFQ9UMX5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NENFQ9UMX5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NENFQ9UMX5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NENFQ9UMX5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NENFQ9UMX5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NENFQ9UMX5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
NENFQ9UMX5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NENFQ9UMX5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NENFQ9UMX5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NENFQ9UMX5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NENFQ9UMX5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NENFQ9UMX5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NENFQ9UMX5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NENFQ9UMX5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NENFQ9UMX5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NENFQ9UMX5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NENFQ9UMX5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NENFQ9UMX5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NENFQ9UMX5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NENFQ9UMX5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NENFQ9UMX5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NENFQ9UMX5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NENFQ9UMX5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NENFQ9UMX5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NENFQ9UMX5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NENFQ9UMX5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NENFQ9UMX5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NENFQ9UMX5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NENFQ9UMX5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NENFQ9UMX5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NENFQ9UMX5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NENFQ9UMX5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NENFQ9UMX5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms