Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MYO6Q9UM54 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYO6Q9UM54 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYO6Q9UM54 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
MYO6Q9UM54 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
MYO6Q9UM54 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYO6Q9UM54 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MYO6Q9UM54 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
MYO6Q9UM54 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
MYO6Q9UM54 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
MYO6Q9UM54 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
MYO6Q9UM54 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MYO6Q9UM54 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
MYO6Q9UM54 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
MYO6Q9UM54 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MYO6Q9UM54 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYO6Q9UM54 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYO6Q9UM54 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MYO6Q9UM54 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYO6Q9UM54 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYO6Q9UM54 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYO6Q9UM54 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYO6Q9UM54 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYO6Q9UM54 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYO6Q9UM54 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYO6Q9UM54 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
MYO6Q9UM54 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MYO6Q9UM54 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MYO6Q9UM54 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MYO6Q9UM54 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
MYO6Q9UM54 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
MYO6Q9UM54 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MYO6Q9UM54 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MYO6Q9UM54 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
MYO6Q9UM54 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
MYO6Q9UM54 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MYO6Q9UM54 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
MYO6Q9UM54 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
MYO6Q9UM54 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MYO6Q9UM54 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MYO6Q9UM54 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MYO6Q9UM54 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MYO6Q9UM54 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MYO6Q9UM54 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MYO6Q9UM54 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MYO6Q9UM54 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MYO6Q9UM54 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
MYO6Q9UM54 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MYO6Q9UM54 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MYO6Q9UM54 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MYO6Q9UM54 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MYO6Q9UM54 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MYO6Q9UM54 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MYO6Q9UM54 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MYO6Q9UM54 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MYO6Q9UM54 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MYO6Q9UM54 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MYO6Q9UM54 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MYO6Q9UM54 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MYO6Q9UM54 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MYO6Q9UM54 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MYO6Q9UM54 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MYO6Q9UM54 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MYO6Q9UM54 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MYO6Q9UM54 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MYO6Q9UM54 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYO6Q9UM54 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MYO6Q9UM54 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MYO6Q9UM54 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MYO6Q9UM54 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MYO6Q9UM54 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MYO6Q9UM54 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MYO6Q9UM54 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYO6Q9UM54 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYO6Q9UM54 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
MYO6Q9UM54 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYO6Q9UM54 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MYO6Q9UM54 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MYO6Q9UM54 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MYO6Q9UM54 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MYO6Q9UM54 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MYO6Q9UM54 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
MYO6Q9UM54 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MYO6Q9UM54 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MYO6Q9UM54 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
MYO6Q9UM54 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
MYO6Q9UM54 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
MYO6Q9UM54 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MYO6Q9UM54 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MYO6Q9UM54 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MYO6Q9UM54 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MYO6Q9UM54 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MYO6Q9UM54 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MYO6Q9UM54 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MYO6Q9UM54 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MYO6Q9UM54 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MYO6Q9UM54 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MYO6Q9UM54 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MYO6Q9UM54 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MYO6Q9UM54 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms