Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLXNB3Q9ULL4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PLXNB3Q9ULL4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNB3Q9ULL4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLXNB3Q9ULL4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNB3Q9ULL4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLXNB3Q9ULL4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNB3Q9ULL4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLXNB3Q9ULL4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLXNB3Q9ULL4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNB3Q9ULL4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNB3Q9ULL4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNB3Q9ULL4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLXNB3Q9ULL4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNB3Q9ULL4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLXNB3Q9ULL4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLXNB3Q9ULL4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLXNB3Q9ULL4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNB3Q9ULL4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNB3Q9ULL4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLXNB3Q9ULL4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNB3Q9ULL4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PLXNB3Q9ULL4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PLXNB3Q9ULL4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLXNB3Q9ULL4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNB3Q9ULL4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLXNB3Q9ULL4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLXNB3Q9ULL4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNB3Q9ULL4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNB3Q9ULL4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLXNB3Q9ULL4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLXNB3Q9ULL4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNB3Q9ULL4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLXNB3Q9ULL4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLXNB3Q9ULL4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLXNB3Q9ULL4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNB3Q9ULL4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNB3Q9ULL4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLXNB3Q9ULL4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNB3Q9ULL4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PLXNB3Q9ULL4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PLXNB3Q9ULL4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLXNB3Q9ULL4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLXNB3Q9ULL4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNB3Q9ULL4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNB3Q9ULL4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLXNB3Q9ULL4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNB3Q9ULL4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLXNB3Q9ULL4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PLXNB3Q9ULL4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PLXNB3Q9ULL4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNB3Q9ULL4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNB3Q9ULL4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PLXNB3Q9ULL4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNB3Q9ULL4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLXNB3Q9ULL4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PLXNB3Q9ULL4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNB3Q9ULL4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLXNB3Q9ULL4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLXNB3Q9ULL4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
PLXNB3Q9ULL4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNB3Q9ULL4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLXNB3Q9ULL4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLXNB3Q9ULL4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNB3Q9ULL4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLXNB3Q9ULL4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLXNB3Q9ULL4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLXNB3Q9ULL4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PLXNB3Q9ULL4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNB3Q9ULL4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNB3Q9ULL4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNB3Q9ULL4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNB3Q9ULL4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PLXNB3Q9ULL4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PLXNB3Q9ULL4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNB3Q9ULL4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNB3Q9ULL4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PLXNB3Q9ULL4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNB3Q9ULL4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNB3Q9ULL4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PLXNB3Q9ULL4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNB3Q9ULL4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PLXNB3Q9ULL4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PLXNB3Q9ULL4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PLXNB3Q9ULL4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNB3Q9ULL4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLXNB3Q9ULL4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNB3Q9ULL4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PLXNB3Q9ULL4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNB3Q9ULL4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLXNB3Q9ULL4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNB3Q9ULL4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNB3Q9ULL4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNB3Q9ULL4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNB3Q9ULL4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLXNB3Q9ULL4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PLXNB3Q9ULL4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PLXNB3Q9ULL4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNB3Q9ULL4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLXNB3Q9ULL4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms