Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PADI1Q9ULC6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PADI1Q9ULC6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PADI1Q9ULC6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PADI1Q9ULC6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PADI1Q9ULC6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PADI1Q9ULC6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PADI1Q9ULC6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PADI1Q9ULC6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PADI1Q9ULC6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PADI1Q9ULC6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PADI1Q9ULC6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PADI1Q9ULC6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PADI1Q9ULC6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PADI1Q9ULC6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PADI1Q9ULC6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PADI1Q9ULC6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PADI1Q9ULC6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PADI1Q9ULC6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PADI1Q9ULC6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PADI1Q9ULC6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PADI1Q9ULC6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PADI1Q9ULC6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PADI1Q9ULC6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PADI1Q9ULC6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PADI1Q9ULC6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PADI1Q9ULC6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PADI1Q9ULC6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PADI1Q9ULC6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PADI1Q9ULC6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PADI1Q9ULC6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PADI1Q9ULC6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PADI1Q9ULC6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PADI1Q9ULC6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PADI1Q9ULC6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PADI1Q9ULC6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PADI1Q9ULC6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PADI1Q9ULC6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PADI1Q9ULC6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PADI1Q9ULC6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PADI1Q9ULC6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PADI1Q9ULC6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PADI1Q9ULC6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PADI1Q9ULC6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PADI1Q9ULC6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PADI1Q9ULC6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PADI1Q9ULC6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PADI1Q9ULC6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PADI1Q9ULC6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PADI1Q9ULC6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PADI1Q9ULC6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PADI1Q9ULC6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PADI1Q9ULC6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PADI1Q9ULC6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PADI1Q9ULC6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PADI1Q9ULC6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PADI1Q9ULC6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PADI1Q9ULC6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PADI1Q9ULC6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PADI1Q9ULC6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PADI1Q9ULC6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PADI1Q9ULC6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PADI1Q9ULC6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI1Q9ULC6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PADI1Q9ULC6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PADI1Q9ULC6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PADI1Q9ULC6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PADI1Q9ULC6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PADI1Q9ULC6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PADI1Q9ULC6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PADI1Q9ULC6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PADI1Q9ULC6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PADI1Q9ULC6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PADI1Q9ULC6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PADI1Q9ULC6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PADI1Q9ULC6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PADI1Q9ULC6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PADI1Q9ULC6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PADI1Q9ULC6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PADI1Q9ULC6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PADI1Q9ULC6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PADI1Q9ULC6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PADI1Q9ULC6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PADI1Q9ULC6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PADI1Q9ULC6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PADI1Q9ULC6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PADI1Q9ULC6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PADI1Q9ULC6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PADI1Q9ULC6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PADI1Q9ULC6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PADI1Q9ULC6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PADI1Q9ULC6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PADI1Q9ULC6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PADI1Q9ULC6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PADI1Q9ULC6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PADI1Q9ULC6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PADI1Q9ULC6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PADI1Q9ULC6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PADI1Q9ULC6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PADI1Q9ULC6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms