Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK17

KCND3, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND3Q9UK17 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCND3Q9UK17 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCND3Q9UK17 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCND3Q9UK17 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCND3Q9UK17 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCND3Q9UK17 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCND3Q9UK17 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCND3Q9UK17 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCND3Q9UK17 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCND3Q9UK17 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCND3Q9UK17 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCND3Q9UK17 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCND3Q9UK17 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms