Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK17

KCND3, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND3Q9UK17 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCND3Q9UK17 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCND3Q9UK17 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCND3Q9UK17 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCND3Q9UK17 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCND3Q9UK17 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCND3Q9UK17 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCND3Q9UK17 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCND3Q9UK17 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCND3Q9UK17 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCND3Q9UK17 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCND3Q9UK17 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCND3Q9UK17 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KCND3Q9UK17 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCND3Q9UK17 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCND3Q9UK17 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCND3Q9UK17 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCND3Q9UK17 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCND3Q9UK17 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCND3Q9UK17 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCND3Q9UK17 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms