Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KLHL3Q9UH77 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KLHL3Q9UH77 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL3Q9UH77 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL3Q9UH77 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KLHL3Q9UH77 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL3Q9UH77 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KLHL3Q9UH77 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KLHL3Q9UH77 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KLHL3Q9UH77 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KLHL3Q9UH77 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KLHL3Q9UH77 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KLHL3Q9UH77 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KLHL3Q9UH77 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KLHL3Q9UH77 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL3Q9UH77 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL3Q9UH77 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KLHL3Q9UH77 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHL3Q9UH77 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KLHL3Q9UH77 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KLHL3Q9UH77 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL3Q9UH77 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL3Q9UH77 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KLHL3Q9UH77 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL3Q9UH77 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KLHL3Q9UH77 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL3Q9UH77 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL3Q9UH77 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL3Q9UH77 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL3Q9UH77 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL3Q9UH77 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL3Q9UH77 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL3Q9UH77 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL3Q9UH77 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL3Q9UH77 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL3Q9UH77 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL3Q9UH77 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KLHL3Q9UH77 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL3Q9UH77 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL3Q9UH77 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KLHL3Q9UH77 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL3Q9UH77 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KLHL3Q9UH77 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KLHL3Q9UH77 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL3Q9UH77 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL3Q9UH77 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL3Q9UH77 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL3Q9UH77 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KLHL3Q9UH77 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KLHL3Q9UH77 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL3Q9UH77 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KLHL3Q9UH77 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KLHL3Q9UH77 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL3Q9UH77 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL3Q9UH77 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KLHL3Q9UH77 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL3Q9UH77 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KLHL3Q9UH77 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KLHL3Q9UH77 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL3Q9UH77 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KLHL3Q9UH77 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KLHL3Q9UH77 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL3Q9UH77 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL3Q9UH77 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KLHL3Q9UH77 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL3Q9UH77 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL3Q9UH77 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL3Q9UH77 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL3Q9UH77 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL3Q9UH77 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KLHL3Q9UH77 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL3Q9UH77 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KLHL3Q9UH77 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL3Q9UH77 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KLHL3Q9UH77 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KLHL3Q9UH77 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL3Q9UH77 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL3Q9UH77 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL3Q9UH77 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KLHL3Q9UH77 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL3Q9UH77 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL3Q9UH77 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL3Q9UH77 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KLHL3Q9UH77 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KLHL3Q9UH77 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL3Q9UH77 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL3Q9UH77 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL3Q9UH77 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KLHL3Q9UH77 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL3Q9UH77 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL3Q9UH77 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KLHL3Q9UH77 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL3Q9UH77 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL3Q9UH77 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KLHL3Q9UH77 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL3Q9UH77 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL3Q9UH77 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KLHL3Q9UH77 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL3Q9UH77 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KLHL3Q9UH77 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms