Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EBF1Q9UH73 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
EBF1Q9UH73 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
EBF1Q9UH73 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
EBF1Q9UH73 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EBF1Q9UH73 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EBF1Q9UH73 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EBF1Q9UH73 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
EBF1Q9UH73 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EBF1Q9UH73 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
EBF1Q9UH73 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EBF1Q9UH73 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EBF1Q9UH73 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EBF1Q9UH73 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EBF1Q9UH73 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EBF1Q9UH73 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EBF1Q9UH73 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EBF1Q9UH73 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EBF1Q9UH73 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EBF1Q9UH73 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EBF1Q9UH73 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EBF1Q9UH73 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EBF1Q9UH73 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EBF1Q9UH73 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EBF1Q9UH73 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EBF1Q9UH73 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
EBF1Q9UH73 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EBF1Q9UH73 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EBF1Q9UH73 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EBF1Q9UH73 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EBF1Q9UH73 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EBF1Q9UH73 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EBF1Q9UH73 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EBF1Q9UH73 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EBF1Q9UH73 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EBF1Q9UH73 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EBF1Q9UH73 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EBF1Q9UH73 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EBF1Q9UH73 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EBF1Q9UH73 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EBF1Q9UH73 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EBF1Q9UH73 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EBF1Q9UH73 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EBF1Q9UH73 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EBF1Q9UH73 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EBF1Q9UH73 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EBF1Q9UH73 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EBF1Q9UH73 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EBF1Q9UH73 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EBF1Q9UH73 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EBF1Q9UH73 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EBF1Q9UH73 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EBF1Q9UH73 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EBF1Q9UH73 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EBF1Q9UH73 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EBF1Q9UH73 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
EBF1Q9UH73 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EBF1Q9UH73 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EBF1Q9UH73 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EBF1Q9UH73 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EBF1Q9UH73 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EBF1Q9UH73 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EBF1Q9UH73 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EBF1Q9UH73 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EBF1Q9UH73 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EBF1Q9UH73 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EBF1Q9UH73 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
EBF1Q9UH73 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EBF1Q9UH73 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EBF1Q9UH73 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EBF1Q9UH73 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EBF1Q9UH73 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EBF1Q9UH73 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EBF1Q9UH73 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EBF1Q9UH73 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EBF1Q9UH73 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
EBF1Q9UH73 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
EBF1Q9UH73 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EBF1Q9UH73 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EBF1Q9UH73 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EBF1Q9UH73 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EBF1Q9UH73 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EBF1Q9UH73 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EBF1Q9UH73 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EBF1Q9UH73 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EBF1Q9UH73 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
EBF1Q9UH73 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EBF1Q9UH73 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EBF1Q9UH73 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EBF1Q9UH73 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EBF1Q9UH73 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EBF1Q9UH73 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EBF1Q9UH73 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EBF1Q9UH73 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EBF1Q9UH73 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EBF1Q9UH73 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EBF1Q9UH73 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EBF1Q9UH73 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EBF1Q9UH73 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EBF1Q9UH73 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms