Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TCF20Q9UGU0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
TCF20Q9UGU0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TCF20Q9UGU0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TCF20Q9UGU0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TCF20Q9UGU0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TCF20Q9UGU0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TCF20Q9UGU0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCF20Q9UGU0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TCF20Q9UGU0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TCF20Q9UGU0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TCF20Q9UGU0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TCF20Q9UGU0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCF20Q9UGU0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TCF20Q9UGU0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TCF20Q9UGU0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TCF20Q9UGU0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TCF20Q9UGU0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TCF20Q9UGU0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TCF20Q9UGU0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TCF20Q9UGU0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TCF20Q9UGU0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TCF20Q9UGU0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TCF20Q9UGU0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TCF20Q9UGU0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TCF20Q9UGU0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TCF20Q9UGU0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TCF20Q9UGU0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TCF20Q9UGU0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TCF20Q9UGU0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TCF20Q9UGU0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TCF20Q9UGU0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TCF20Q9UGU0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TCF20Q9UGU0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCF20Q9UGU0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TCF20Q9UGU0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCF20Q9UGU0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TCF20Q9UGU0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TCF20Q9UGU0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TCF20Q9UGU0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCF20Q9UGU0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TCF20Q9UGU0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCF20Q9UGU0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TCF20Q9UGU0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TCF20Q9UGU0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
TCF20Q9UGU0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCF20Q9UGU0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TCF20Q9UGU0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TCF20Q9UGU0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TCF20Q9UGU0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TCF20Q9UGU0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCF20Q9UGU0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCF20Q9UGU0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TCF20Q9UGU0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TCF20Q9UGU0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TCF20Q9UGU0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TCF20Q9UGU0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TCF20Q9UGU0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TCF20Q9UGU0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TCF20Q9UGU0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TCF20Q9UGU0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TCF20Q9UGU0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TCF20Q9UGU0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TCF20Q9UGU0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TCF20Q9UGU0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TCF20Q9UGU0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TCF20Q9UGU0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TCF20Q9UGU0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCF20Q9UGU0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TCF20Q9UGU0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TCF20Q9UGU0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TCF20Q9UGU0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TCF20Q9UGU0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TCF20Q9UGU0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TCF20Q9UGU0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TCF20Q9UGU0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TCF20Q9UGU0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TCF20Q9UGU0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TCF20Q9UGU0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TCF20Q9UGU0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TCF20Q9UGU0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TCF20Q9UGU0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TCF20Q9UGU0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TCF20Q9UGU0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TCF20Q9UGU0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TCF20Q9UGU0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TCF20Q9UGU0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TCF20Q9UGU0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TCF20Q9UGU0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TCF20Q9UGU0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TCF20Q9UGU0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TCF20Q9UGU0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TCF20Q9UGU0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TCF20Q9UGU0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TCF20Q9UGU0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TCF20Q9UGU0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TCF20Q9UGU0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TCF20Q9UGU0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TCF20Q9UGU0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TCF20Q9UGU0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms