Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PPP1R1BQ9UD71 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PPP1R1BQ9UD71 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PPP1R1BQ9UD71 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PPP1R1BQ9UD71 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PPP1R1BQ9UD71 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PPP1R1BQ9UD71 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PPP1R1BQ9UD71 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
PPP1R1BQ9UD71 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PPP1R1BQ9UD71 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
PPP1R1BQ9UD71 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PPP1R1BQ9UD71 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PPP1R1BQ9UD71 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PPP1R1BQ9UD71 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PPP1R1BQ9UD71 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PPP1R1BQ9UD71 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
PPP1R1BQ9UD71 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PPP1R1BQ9UD71 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PPP1R1BQ9UD71 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
PPP1R1BQ9UD71 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
PPP1R1BQ9UD71 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PPP1R1BQ9UD71 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PPP1R1BQ9UD71 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PPP1R1BQ9UD71 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PPP1R1BQ9UD71 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PPP1R1BQ9UD71 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PPP1R1BQ9UD71 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
PPP1R1BQ9UD71 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PPP1R1BQ9UD71 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PPP1R1BQ9UD71 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PPP1R1BQ9UD71 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
PPP1R1BQ9UD71 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PPP1R1BQ9UD71 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PPP1R1BQ9UD71 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PPP1R1BQ9UD71 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
PPP1R1BQ9UD71 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
PPP1R1BQ9UD71 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
PPP1R1BQ9UD71 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PPP1R1BQ9UD71 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PPP1R1BQ9UD71 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
PPP1R1BQ9UD71 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PPP1R1BQ9UD71 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PPP1R1BQ9UD71 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PPP1R1BQ9UD71 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
PPP1R1BQ9UD71 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PPP1R1BQ9UD71 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PPP1R1BQ9UD71 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
PPP1R1BQ9UD71 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PPP1R1BQ9UD71 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PPP1R1BQ9UD71 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PPP1R1BQ9UD71 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
PPP1R1BQ9UD71 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PPP1R1BQ9UD71 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PPP1R1BQ9UD71 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PPP1R1BQ9UD71 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PPP1R1BQ9UD71 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PPP1R1BQ9UD71 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PPP1R1BQ9UD71 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PPP1R1BQ9UD71 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
PPP1R1BQ9UD71 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PPP1R1BQ9UD71 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PPP1R1BQ9UD71 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PPP1R1BQ9UD71 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PPP1R1BQ9UD71 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PPP1R1BQ9UD71 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PPP1R1BQ9UD71 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PPP1R1BQ9UD71 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PPP1R1BQ9UD71 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
PPP1R1BQ9UD71 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PPP1R1BQ9UD71 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
PPP1R1BQ9UD71 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
PPP1R1BQ9UD71 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
PPP1R1BQ9UD71 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
PPP1R1BQ9UD71 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PPP1R1BQ9UD71 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PPP1R1BQ9UD71 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PPP1R1BQ9UD71 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
PPP1R1BQ9UD71 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PPP1R1BQ9UD71 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PPP1R1BQ9UD71 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PPP1R1BQ9UD71 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
PPP1R1BQ9UD71 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PPP1R1BQ9UD71 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PPP1R1BQ9UD71 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PPP1R1BQ9UD71 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
PPP1R1BQ9UD71 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PPP1R1BQ9UD71 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
PPP1R1BQ9UD71 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PPP1R1BQ9UD71 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PPP1R1BQ9UD71 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PPP1R1BQ9UD71 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PPP1R1BQ9UD71 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPP1R1BQ9UD71 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPP1R1BQ9UD71 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPP1R1BQ9UD71 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PPP1R1BQ9UD71 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PPP1R1BQ9UD71 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PPP1R1BQ9UD71 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PPP1R1BQ9UD71 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PPP1R1BQ9UD71 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms