Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATXN10Q9UBB4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATXN10Q9UBB4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATXN10Q9UBB4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATXN10Q9UBB4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATXN10Q9UBB4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATXN10Q9UBB4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATXN10Q9UBB4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN10Q9UBB4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN10Q9UBB4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATXN10Q9UBB4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATXN10Q9UBB4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATXN10Q9UBB4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATXN10Q9UBB4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATXN10Q9UBB4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
ATXN10Q9UBB4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATXN10Q9UBB4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATXN10Q9UBB4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATXN10Q9UBB4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATXN10Q9UBB4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATXN10Q9UBB4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ATXN10Q9UBB4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATXN10Q9UBB4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATXN10Q9UBB4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATXN10Q9UBB4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATXN10Q9UBB4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATXN10Q9UBB4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ATXN10Q9UBB4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATXN10Q9UBB4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ATXN10Q9UBB4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATXN10Q9UBB4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATXN10Q9UBB4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATXN10Q9UBB4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATXN10Q9UBB4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATXN10Q9UBB4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATXN10Q9UBB4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATXN10Q9UBB4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATXN10Q9UBB4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATXN10Q9UBB4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN10Q9UBB4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN10Q9UBB4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATXN10Q9UBB4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATXN10Q9UBB4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATXN10Q9UBB4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ATXN10Q9UBB4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATXN10Q9UBB4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATXN10Q9UBB4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATXN10Q9UBB4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATXN10Q9UBB4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATXN10Q9UBB4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATXN10Q9UBB4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATXN10Q9UBB4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATXN10Q9UBB4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATXN10Q9UBB4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATXN10Q9UBB4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN10Q9UBB4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN10Q9UBB4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATXN10Q9UBB4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ATXN10Q9UBB4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATXN10Q9UBB4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATXN10Q9UBB4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATXN10Q9UBB4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN10Q9UBB4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATXN10Q9UBB4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATXN10Q9UBB4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATXN10Q9UBB4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATXN10Q9UBB4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATXN10Q9UBB4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATXN10Q9UBB4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATXN10Q9UBB4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATXN10Q9UBB4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATXN10Q9UBB4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATXN10Q9UBB4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATXN10Q9UBB4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATXN10Q9UBB4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATXN10Q9UBB4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATXN10Q9UBB4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATXN10Q9UBB4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATXN10Q9UBB4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATXN10Q9UBB4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATXN10Q9UBB4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATXN10Q9UBB4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATXN10Q9UBB4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATXN10Q9UBB4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATXN10Q9UBB4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATXN10Q9UBB4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATXN10Q9UBB4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATXN10Q9UBB4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATXN10Q9UBB4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATXN10Q9UBB4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATXN10Q9UBB4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATXN10Q9UBB4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATXN10Q9UBB4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATXN10Q9UBB4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATXN10Q9UBB4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATXN10Q9UBB4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATXN10Q9UBB4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATXN10Q9UBB4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ATXN10Q9UBB4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATXN10Q9UBB4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms