Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
REREQ9P2R6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
REREQ9P2R6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
REREQ9P2R6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
REREQ9P2R6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
REREQ9P2R6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
REREQ9P2R6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
REREQ9P2R6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
REREQ9P2R6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
REREQ9P2R6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.63■■■■■ 4.41
REREQ9P2R6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
REREQ9P2R6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
REREQ9P2R6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.56■■■■■ 4.4
REREQ9P2R6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
REREQ9P2R6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.55■■■■■ 4.4
REREQ9P2R6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
REREQ9P2R6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
REREQ9P2R6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
REREQ9P2R6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
REREQ9P2R6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.51■■■■■ 4.4
REREQ9P2R6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
REREQ9P2R6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
REREQ9P2R6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
REREQ9P2R6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
REREQ9P2R6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
REREQ9P2R6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
REREQ9P2R6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.39
REREQ9P2R6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
REREQ9P2R6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
REREQ9P2R6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC42.35■■■■■ 4.37
REREQ9P2R6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
REREQ9P2R6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
REREQ9P2R6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC42.32■■■■■ 4.37
REREQ9P2R6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.31■■■■■ 4.36
REREQ9P2R6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
REREQ9P2R6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
REREQ9P2R6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
REREQ9P2R6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.25■■■■■ 4.35
REREQ9P2R6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
REREQ9P2R6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
REREQ9P2R6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
REREQ9P2R6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
REREQ9P2R6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
REREQ9P2R6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
REREQ9P2R6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
REREQ9P2R6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
REREQ9P2R6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
REREQ9P2R6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.14■■■■■ 4.34
REREQ9P2R6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
REREQ9P2R6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.12■■■■■ 4.33
REREQ9P2R6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
REREQ9P2R6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
REREQ9P2R6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
REREQ9P2R6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
REREQ9P2R6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
REREQ9P2R6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
REREQ9P2R6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
REREQ9P2R6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
REREQ9P2R6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
REREQ9P2R6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
REREQ9P2R6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
REREQ9P2R6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
REREQ9P2R6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
REREQ9P2R6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
REREQ9P2R6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
REREQ9P2R6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.93■■■■■ 4.3
REREQ9P2R6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
REREQ9P2R6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
REREQ9P2R6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
REREQ9P2R6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.3
REREQ9P2R6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
REREQ9P2R6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
REREQ9P2R6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.29
REREQ9P2R6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
REREQ9P2R6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
REREQ9P2R6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
REREQ9P2R6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.8■■■■■ 4.28
REREQ9P2R6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
REREQ9P2R6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
REREQ9P2R6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
REREQ9P2R6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.78■■■■■ 4.28
REREQ9P2R6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
REREQ9P2R6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
REREQ9P2R6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
REREQ9P2R6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
REREQ9P2R6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
REREQ9P2R6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
REREQ9P2R6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
REREQ9P2R6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
REREQ9P2R6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
REREQ9P2R6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
REREQ9P2R6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
REREQ9P2R6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.26
REREQ9P2R6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
REREQ9P2R6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
REREQ9P2R6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
REREQ9P2R6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
REREQ9P2R6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
REREQ9P2R6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.58■■■■■ 4.25
REREQ9P2R6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms