Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
ARHGEF12Q9NZN5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
ARHGEF12Q9NZN5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
ARHGEF12Q9NZN5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
ARHGEF12Q9NZN5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
ARHGEF12Q9NZN5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
ARHGEF12Q9NZN5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
ARHGEF12Q9NZN5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
ARHGEF12Q9NZN5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC43.12■■■■■ 4.49
ARHGEF12Q9NZN5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ARHGEF12Q9NZN5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
ARHGEF12Q9NZN5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
ARHGEF12Q9NZN5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
ARHGEF12Q9NZN5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
ARHGEF12Q9NZN5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
ARHGEF12Q9NZN5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
ARHGEF12Q9NZN5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
ARHGEF12Q9NZN5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
ARHGEF12Q9NZN5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
ARHGEF12Q9NZN5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
ARHGEF12Q9NZN5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
ARHGEF12Q9NZN5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
ARHGEF12Q9NZN5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.79■■■■■ 4.44
ARHGEF12Q9NZN5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
ARHGEF12Q9NZN5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
ARHGEF12Q9NZN5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
ARHGEF12Q9NZN5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
ARHGEF12Q9NZN5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
ARHGEF12Q9NZN5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
ARHGEF12Q9NZN5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.72■■■■■ 4.43
ARHGEF12Q9NZN5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
ARHGEF12Q9NZN5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.43
ARHGEF12Q9NZN5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
ARHGEF12Q9NZN5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
ARHGEF12Q9NZN5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
ARHGEF12Q9NZN5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
ARHGEF12Q9NZN5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
ARHGEF12Q9NZN5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
ARHGEF12Q9NZN5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.63■■■■■ 4.42
ARHGEF12Q9NZN5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
ARHGEF12Q9NZN5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.61■■■■■ 4.41
ARHGEF12Q9NZN5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
ARHGEF12Q9NZN5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
ARHGEF12Q9NZN5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
ARHGEF12Q9NZN5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
ARHGEF12Q9NZN5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC42.58■■■■■ 4.41
ARHGEF12Q9NZN5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
ARHGEF12Q9NZN5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
ARHGEF12Q9NZN5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
ARHGEF12Q9NZN5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
ARHGEF12Q9NZN5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
ARHGEF12Q9NZN5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
ARHGEF12Q9NZN5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
ARHGEF12Q9NZN5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.51■■■■■ 4.39
ARHGEF12Q9NZN5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
ARHGEF12Q9NZN5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
ARHGEF12Q9NZN5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.46■■■■■ 4.39
ARHGEF12Q9NZN5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
ARHGEF12Q9NZN5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
ARHGEF12Q9NZN5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.4■■■■■ 4.38
ARHGEF12Q9NZN5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC42.4■■■■■ 4.38
ARHGEF12Q9NZN5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
ARHGEF12Q9NZN5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
ARHGEF12Q9NZN5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ARHGEF12Q9NZN5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
ARHGEF12Q9NZN5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
ARHGEF12Q9NZN5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
ARHGEF12Q9NZN5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
ARHGEF12Q9NZN5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
ARHGEF12Q9NZN5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
ARHGEF12Q9NZN5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
ARHGEF12Q9NZN5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARHGEF12Q9NZN5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARHGEF12Q9NZN5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
ARHGEF12Q9NZN5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
ARHGEF12Q9NZN5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
ARHGEF12Q9NZN5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
ARHGEF12Q9NZN5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
ARHGEF12Q9NZN5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ARHGEF12Q9NZN5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ARHGEF12Q9NZN5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
ARHGEF12Q9NZN5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
ARHGEF12Q9NZN5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.22■■■■■ 4.35
ARHGEF12Q9NZN5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
ARHGEF12Q9NZN5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
ARHGEF12Q9NZN5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
ARHGEF12Q9NZN5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
ARHGEF12Q9NZN5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
ARHGEF12Q9NZN5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.07■■■■■ 4.33
ARHGEF12Q9NZN5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
ARHGEF12Q9NZN5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
ARHGEF12Q9NZN5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
ARHGEF12Q9NZN5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
ARHGEF12Q9NZN5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms