Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RRN3Q9NYV6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RRN3Q9NYV6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RRN3Q9NYV6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
RRN3Q9NYV6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RRN3Q9NYV6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRN3Q9NYV6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRN3Q9NYV6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRN3Q9NYV6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RRN3Q9NYV6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RRN3Q9NYV6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RRN3Q9NYV6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RRN3Q9NYV6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RRN3Q9NYV6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRN3Q9NYV6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RRN3Q9NYV6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RRN3Q9NYV6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RRN3Q9NYV6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRN3Q9NYV6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRN3Q9NYV6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RRN3Q9NYV6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRN3Q9NYV6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRN3Q9NYV6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RRN3Q9NYV6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RRN3Q9NYV6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RRN3Q9NYV6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RRN3Q9NYV6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRN3Q9NYV6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRN3Q9NYV6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RRN3Q9NYV6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRN3Q9NYV6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RRN3Q9NYV6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRN3Q9NYV6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRN3Q9NYV6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRN3Q9NYV6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RRN3Q9NYV6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRN3Q9NYV6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRN3Q9NYV6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRN3Q9NYV6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RRN3Q9NYV6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RRN3Q9NYV6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RRN3Q9NYV6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RRN3Q9NYV6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RRN3Q9NYV6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRN3Q9NYV6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RRN3Q9NYV6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RRN3Q9NYV6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RRN3Q9NYV6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RRN3Q9NYV6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RRN3Q9NYV6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RRN3Q9NYV6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RRN3Q9NYV6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRN3Q9NYV6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRN3Q9NYV6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RRN3Q9NYV6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RRN3Q9NYV6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRN3Q9NYV6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRN3Q9NYV6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRN3Q9NYV6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RRN3Q9NYV6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRN3Q9NYV6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRN3Q9NYV6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRN3Q9NYV6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRN3Q9NYV6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRN3Q9NYV6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRN3Q9NYV6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRN3Q9NYV6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRN3Q9NYV6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRN3Q9NYV6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRN3Q9NYV6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRN3Q9NYV6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RRN3Q9NYV6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RRN3Q9NYV6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRN3Q9NYV6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRN3Q9NYV6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RRN3Q9NYV6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRN3Q9NYV6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RRN3Q9NYV6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RRN3Q9NYV6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRN3Q9NYV6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RRN3Q9NYV6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
RRN3Q9NYV6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRN3Q9NYV6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRN3Q9NYV6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RRN3Q9NYV6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRN3Q9NYV6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RRN3Q9NYV6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RRN3Q9NYV6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RRN3Q9NYV6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRN3Q9NYV6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRN3Q9NYV6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRN3Q9NYV6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRN3Q9NYV6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRN3Q9NYV6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRN3Q9NYV6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRN3Q9NYV6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRN3Q9NYV6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RRN3Q9NYV6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRN3Q9NYV6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRN3Q9NYV6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms