Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLCO1C1Q9NYB5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLCO1C1Q9NYB5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLCO1C1Q9NYB5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLCO1C1Q9NYB5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLCO1C1Q9NYB5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLCO1C1Q9NYB5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLCO1C1Q9NYB5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLCO1C1Q9NYB5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLCO1C1Q9NYB5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLCO1C1Q9NYB5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLCO1C1Q9NYB5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLCO1C1Q9NYB5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLCO1C1Q9NYB5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLCO1C1Q9NYB5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLCO1C1Q9NYB5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLCO1C1Q9NYB5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLCO1C1Q9NYB5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLCO1C1Q9NYB5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLCO1C1Q9NYB5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO1C1Q9NYB5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLCO1C1Q9NYB5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLCO1C1Q9NYB5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO1C1Q9NYB5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO1C1Q9NYB5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLCO1C1Q9NYB5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLCO1C1Q9NYB5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLCO1C1Q9NYB5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLCO1C1Q9NYB5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLCO1C1Q9NYB5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO1C1Q9NYB5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLCO1C1Q9NYB5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO1C1Q9NYB5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLCO1C1Q9NYB5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLCO1C1Q9NYB5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLCO1C1Q9NYB5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLCO1C1Q9NYB5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO1C1Q9NYB5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLCO1C1Q9NYB5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO1C1Q9NYB5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO1C1Q9NYB5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLCO1C1Q9NYB5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLCO1C1Q9NYB5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO1C1Q9NYB5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLCO1C1Q9NYB5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO1C1Q9NYB5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO1C1Q9NYB5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLCO1C1Q9NYB5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO1C1Q9NYB5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO1C1Q9NYB5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO1C1Q9NYB5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO1C1Q9NYB5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLCO1C1Q9NYB5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLCO1C1Q9NYB5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLCO1C1Q9NYB5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO1C1Q9NYB5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO1C1Q9NYB5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLCO1C1Q9NYB5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO1C1Q9NYB5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO1C1Q9NYB5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO1C1Q9NYB5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLCO1C1Q9NYB5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLCO1C1Q9NYB5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLCO1C1Q9NYB5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO1C1Q9NYB5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO1C1Q9NYB5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLCO1C1Q9NYB5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLCO1C1Q9NYB5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO1C1Q9NYB5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO1C1Q9NYB5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO1C1Q9NYB5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1C1Q9NYB5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1C1Q9NYB5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLCO1C1Q9NYB5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLCO1C1Q9NYB5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1C1Q9NYB5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1C1Q9NYB5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1C1Q9NYB5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1C1Q9NYB5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLCO1C1Q9NYB5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO1C1Q9NYB5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLCO1C1Q9NYB5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO1C1Q9NYB5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLCO1C1Q9NYB5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLCO1C1Q9NYB5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLCO1C1Q9NYB5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLCO1C1Q9NYB5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLCO1C1Q9NYB5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLCO1C1Q9NYB5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLCO1C1Q9NYB5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLCO1C1Q9NYB5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLCO1C1Q9NYB5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLCO1C1Q9NYB5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLCO1C1Q9NYB5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLCO1C1Q9NYB5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLCO1C1Q9NYB5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms