Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
CNTLNQ9NXG0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
CNTLNQ9NXG0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CNTLNQ9NXG0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CNTLNQ9NXG0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CNTLNQ9NXG0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
CNTLNQ9NXG0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42.28■■■■■ 4.36
CNTLNQ9NXG0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CNTLNQ9NXG0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
CNTLNQ9NXG0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
CNTLNQ9NXG0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
CNTLNQ9NXG0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
CNTLNQ9NXG0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CNTLNQ9NXG0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CNTLNQ9NXG0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC42.2■■■■■ 4.35
CNTLNQ9NXG0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
CNTLNQ9NXG0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
CNTLNQ9NXG0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
CNTLNQ9NXG0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
CNTLNQ9NXG0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
CNTLNQ9NXG0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
CNTLNQ9NXG0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
CNTLNQ9NXG0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
CNTLNQ9NXG0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.11■■■■■ 4.33
CNTLNQ9NXG0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
CNTLNQ9NXG0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
CNTLNQ9NXG0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
CNTLNQ9NXG0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CNTLNQ9NXG0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.01■■■■■ 4.32
CNTLNQ9NXG0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
CNTLNQ9NXG0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CNTLNQ9NXG0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CNTLNQ9NXG0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CNTLNQ9NXG0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CNTLNQ9NXG0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
CNTLNQ9NXG0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
CNTLNQ9NXG0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
CNTLNQ9NXG0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CNTLNQ9NXG0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CNTLNQ9NXG0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CNTLNQ9NXG0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CNTLNQ9NXG0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CNTLNQ9NXG0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CNTLNQ9NXG0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CNTLNQ9NXG0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CNTLNQ9NXG0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CNTLNQ9NXG0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CNTLNQ9NXG0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CNTLNQ9NXG0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.27
CNTLNQ9NXG0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CNTLNQ9NXG0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CNTLNQ9NXG0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CNTLNQ9NXG0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CNTLNQ9NXG0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CNTLNQ9NXG0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CNTLNQ9NXG0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CNTLNQ9NXG0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC41.67■■■■■ 4.26
CNTLNQ9NXG0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CNTLNQ9NXG0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
CNTLNQ9NXG0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
CNTLNQ9NXG0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
CNTLNQ9NXG0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
CNTLNQ9NXG0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CNTLNQ9NXG0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
CNTLNQ9NXG0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
CNTLNQ9NXG0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.61■■■■■ 4.25
CNTLNQ9NXG0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
CNTLNQ9NXG0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
CNTLNQ9NXG0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
CNTLNQ9NXG0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
CNTLNQ9NXG0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
CNTLNQ9NXG0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
CNTLNQ9NXG0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CNTLNQ9NXG0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CNTLNQ9NXG0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CNTLNQ9NXG0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
CNTLNQ9NXG0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CNTLNQ9NXG0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CNTLNQ9NXG0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CNTLNQ9NXG0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
CNTLNQ9NXG0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CNTLNQ9NXG0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CNTLNQ9NXG0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CNTLNQ9NXG0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
CNTLNQ9NXG0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CNTLNQ9NXG0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CNTLNQ9NXG0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CNTLNQ9NXG0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
CNTLNQ9NXG0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CNTLNQ9NXG0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
CNTLNQ9NXG0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CNTLNQ9NXG0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
CNTLNQ9NXG0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CNTLNQ9NXG0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CNTLNQ9NXG0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CNTLNQ9NXG0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CNTLNQ9NXG0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CNTLNQ9NXG0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CNTLNQ9NXG0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CNTLNQ9NXG0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms