Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
POLR3EQ9NVU0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
POLR3EQ9NVU0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
POLR3EQ9NVU0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
POLR3EQ9NVU0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
POLR3EQ9NVU0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
POLR3EQ9NVU0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
POLR3EQ9NVU0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
POLR3EQ9NVU0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
POLR3EQ9NVU0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
POLR3EQ9NVU0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
POLR3EQ9NVU0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLR3EQ9NVU0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLR3EQ9NVU0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLR3EQ9NVU0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
POLR3EQ9NVU0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
POLR3EQ9NVU0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
POLR3EQ9NVU0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLR3EQ9NVU0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLR3EQ9NVU0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLR3EQ9NVU0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR3EQ9NVU0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLR3EQ9NVU0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLR3EQ9NVU0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
POLR3EQ9NVU0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLR3EQ9NVU0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLR3EQ9NVU0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
POLR3EQ9NVU0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLR3EQ9NVU0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
POLR3EQ9NVU0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
POLR3EQ9NVU0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
POLR3EQ9NVU0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR3EQ9NVU0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR3EQ9NVU0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
POLR3EQ9NVU0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
POLR3EQ9NVU0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
POLR3EQ9NVU0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLR3EQ9NVU0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
POLR3EQ9NVU0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
POLR3EQ9NVU0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
POLR3EQ9NVU0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
POLR3EQ9NVU0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
POLR3EQ9NVU0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR3EQ9NVU0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR3EQ9NVU0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR3EQ9NVU0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR3EQ9NVU0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
POLR3EQ9NVU0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
POLR3EQ9NVU0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
POLR3EQ9NVU0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
POLR3EQ9NVU0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
POLR3EQ9NVU0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR3EQ9NVU0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR3EQ9NVU0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
POLR3EQ9NVU0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
POLR3EQ9NVU0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
POLR3EQ9NVU0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR3EQ9NVU0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR3EQ9NVU0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
POLR3EQ9NVU0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
POLR3EQ9NVU0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR3EQ9NVU0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR3EQ9NVU0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR3EQ9NVU0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
POLR3EQ9NVU0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
POLR3EQ9NVU0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
POLR3EQ9NVU0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
POLR3EQ9NVU0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
POLR3EQ9NVU0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
POLR3EQ9NVU0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLR3EQ9NVU0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLR3EQ9NVU0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
POLR3EQ9NVU0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
POLR3EQ9NVU0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
POLR3EQ9NVU0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
POLR3EQ9NVU0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
POLR3EQ9NVU0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
POLR3EQ9NVU0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
POLR3EQ9NVU0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
POLR3EQ9NVU0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
POLR3EQ9NVU0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
POLR3EQ9NVU0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
POLR3EQ9NVU0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
POLR3EQ9NVU0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
POLR3EQ9NVU0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
POLR3EQ9NVU0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
POLR3EQ9NVU0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
POLR3EQ9NVU0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
POLR3EQ9NVU0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
POLR3EQ9NVU0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
POLR3EQ9NVU0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
POLR3EQ9NVU0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
POLR3EQ9NVU0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
POLR3EQ9NVU0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
POLR3EQ9NVU0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
POLR3EQ9NVU0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLR3EQ9NVU0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POLR3EQ9NVU0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
POLR3EQ9NVU0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
POLR3EQ9NVU0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms