Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF275Q9NSD4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF275Q9NSD4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF275Q9NSD4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF275Q9NSD4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF275Q9NSD4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF275Q9NSD4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF275Q9NSD4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF275Q9NSD4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF275Q9NSD4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF275Q9NSD4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF275Q9NSD4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF275Q9NSD4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF275Q9NSD4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF275Q9NSD4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF275Q9NSD4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF275Q9NSD4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF275Q9NSD4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF275Q9NSD4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF275Q9NSD4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF275Q9NSD4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF275Q9NSD4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF275Q9NSD4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF275Q9NSD4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF275Q9NSD4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF275Q9NSD4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF275Q9NSD4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF275Q9NSD4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF275Q9NSD4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF275Q9NSD4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF275Q9NSD4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF275Q9NSD4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF275Q9NSD4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF275Q9NSD4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF275Q9NSD4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF275Q9NSD4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF275Q9NSD4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF275Q9NSD4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF275Q9NSD4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF275Q9NSD4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF275Q9NSD4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF275Q9NSD4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF275Q9NSD4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF275Q9NSD4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF275Q9NSD4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF275Q9NSD4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF275Q9NSD4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF275Q9NSD4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF275Q9NSD4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF275Q9NSD4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF275Q9NSD4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF275Q9NSD4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF275Q9NSD4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF275Q9NSD4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF275Q9NSD4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF275Q9NSD4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF275Q9NSD4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF275Q9NSD4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF275Q9NSD4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF275Q9NSD4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF275Q9NSD4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF275Q9NSD4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF275Q9NSD4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF275Q9NSD4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF275Q9NSD4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF275Q9NSD4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF275Q9NSD4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF275Q9NSD4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF275Q9NSD4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF275Q9NSD4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF275Q9NSD4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF275Q9NSD4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF275Q9NSD4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF275Q9NSD4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF275Q9NSD4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF275Q9NSD4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF275Q9NSD4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF275Q9NSD4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF275Q9NSD4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF275Q9NSD4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF275Q9NSD4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF275Q9NSD4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF275Q9NSD4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF275Q9NSD4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF275Q9NSD4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF275Q9NSD4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF275Q9NSD4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF275Q9NSD4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF275Q9NSD4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF275Q9NSD4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF275Q9NSD4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF275Q9NSD4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF275Q9NSD4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF275Q9NSD4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF275Q9NSD4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF275Q9NSD4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF275Q9NSD4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF275Q9NSD4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF275Q9NSD4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF275Q9NSD4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms