Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TM7SF3Q9NS93 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TM7SF3Q9NS93 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TM7SF3Q9NS93 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TM7SF3Q9NS93 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TM7SF3Q9NS93 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TM7SF3Q9NS93 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TM7SF3Q9NS93 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TM7SF3Q9NS93 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TM7SF3Q9NS93 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TM7SF3Q9NS93 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3Q9NS93 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3Q9NS93 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3Q9NS93 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TM7SF3Q9NS93 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TM7SF3Q9NS93 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TM7SF3Q9NS93 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TM7SF3Q9NS93 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM7SF3Q9NS93 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TM7SF3Q9NS93 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TM7SF3Q9NS93 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM7SF3Q9NS93 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM7SF3Q9NS93 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TM7SF3Q9NS93 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TM7SF3Q9NS93 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM7SF3Q9NS93 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TM7SF3Q9NS93 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TM7SF3Q9NS93 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TM7SF3Q9NS93 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
TM7SF3Q9NS93 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TM7SF3Q9NS93 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TM7SF3Q9NS93 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TM7SF3Q9NS93 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM7SF3Q9NS93 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM7SF3Q9NS93 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TM7SF3Q9NS93 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TM7SF3Q9NS93 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TM7SF3Q9NS93 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TM7SF3Q9NS93 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TM7SF3Q9NS93 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TM7SF3Q9NS93 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TM7SF3Q9NS93 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM7SF3Q9NS93 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM7SF3Q9NS93 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TM7SF3Q9NS93 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
TM7SF3Q9NS93 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TM7SF3Q9NS93 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TM7SF3Q9NS93 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TM7SF3Q9NS93 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TM7SF3Q9NS93 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TM7SF3Q9NS93 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TM7SF3Q9NS93 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TM7SF3Q9NS93 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TM7SF3Q9NS93 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TM7SF3Q9NS93 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3Q9NS93 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3Q9NS93 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TM7SF3Q9NS93 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM7SF3Q9NS93 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TM7SF3Q9NS93 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM7SF3Q9NS93 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM7SF3Q9NS93 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TM7SF3Q9NS93 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM7SF3Q9NS93 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TM7SF3Q9NS93 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM7SF3Q9NS93 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM7SF3Q9NS93 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM7SF3Q9NS93 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM7SF3Q9NS93 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM7SF3Q9NS93 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM7SF3Q9NS93 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM7SF3Q9NS93 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM7SF3Q9NS93 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM7SF3Q9NS93 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TM7SF3Q9NS93 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TM7SF3Q9NS93 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TM7SF3Q9NS93 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM7SF3Q9NS93 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TM7SF3Q9NS93 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TM7SF3Q9NS93 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TM7SF3Q9NS93 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TM7SF3Q9NS93 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TM7SF3Q9NS93 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TM7SF3Q9NS93 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TM7SF3Q9NS93 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TM7SF3Q9NS93 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TM7SF3Q9NS93 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TM7SF3Q9NS93 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM7SF3Q9NS93 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TM7SF3Q9NS93 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TM7SF3Q9NS93 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TM7SF3Q9NS93 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TM7SF3Q9NS93 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TM7SF3Q9NS93 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TM7SF3Q9NS93 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TM7SF3Q9NS93 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TM7SF3Q9NS93 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TM7SF3Q9NS93 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TM7SF3Q9NS93 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TM7SF3Q9NS93 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms