Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RASSF1Q9NS23 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASSF1Q9NS23 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASSF1Q9NS23 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RASSF1Q9NS23 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RASSF1Q9NS23 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RASSF1Q9NS23 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASSF1Q9NS23 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RASSF1Q9NS23 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASSF1Q9NS23 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RASSF1Q9NS23 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RASSF1Q9NS23 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASSF1Q9NS23 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RASSF1Q9NS23 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RASSF1Q9NS23 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASSF1Q9NS23 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RASSF1Q9NS23 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF1Q9NS23 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF1Q9NS23 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF1Q9NS23 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RASSF1Q9NS23 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASSF1Q9NS23 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASSF1Q9NS23 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RASSF1Q9NS23 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASSF1Q9NS23 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RASSF1Q9NS23 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RASSF1Q9NS23 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RASSF1Q9NS23 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RASSF1Q9NS23 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RASSF1Q9NS23 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF1Q9NS23 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RASSF1Q9NS23 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RASSF1Q9NS23 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RASSF1Q9NS23 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF1Q9NS23 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF1Q9NS23 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF1Q9NS23 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF1Q9NS23 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF1Q9NS23 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RASSF1Q9NS23 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASSF1Q9NS23 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RASSF1Q9NS23 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RASSF1Q9NS23 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RASSF1Q9NS23 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RASSF1Q9NS23 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RASSF1Q9NS23 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF1Q9NS23 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RASSF1Q9NS23 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF1Q9NS23 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RASSF1Q9NS23 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF1Q9NS23 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RASSF1Q9NS23 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RASSF1Q9NS23 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RASSF1Q9NS23 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF1Q9NS23 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF1Q9NS23 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF1Q9NS23 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RASSF1Q9NS23 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RASSF1Q9NS23 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RASSF1Q9NS23 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RASSF1Q9NS23 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RASSF1Q9NS23 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASSF1Q9NS23 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RASSF1Q9NS23 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASSF1Q9NS23 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RASSF1Q9NS23 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RASSF1Q9NS23 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASSF1Q9NS23 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASSF1Q9NS23 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RASSF1Q9NS23 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RASSF1Q9NS23 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASSF1Q9NS23 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASSF1Q9NS23 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASSF1Q9NS23 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RASSF1Q9NS23 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF1Q9NS23 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RASSF1Q9NS23 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF1Q9NS23 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RASSF1Q9NS23 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RASSF1Q9NS23 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RASSF1Q9NS23 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RASSF1Q9NS23 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RASSF1Q9NS23 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASSF1Q9NS23 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RASSF1Q9NS23 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RASSF1Q9NS23 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASSF1Q9NS23 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RASSF1Q9NS23 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF1Q9NS23 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RASSF1Q9NS23 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF1Q9NS23 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF1Q9NS23 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RASSF1Q9NS23 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASSF1Q9NS23 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RASSF1Q9NS23 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASSF1Q9NS23 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASSF1Q9NS23 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RASSF1Q9NS23 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RASSF1Q9NS23 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RASSF1Q9NS23 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 273.3 ms