Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX4

MYO5C, Unconventional myosin-Vc, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5CQ9NQX4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC43.68■■■■■ 4.58
MYO5CQ9NQX4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
MYO5CQ9NQX4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
MYO5CQ9NQX4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
MYO5CQ9NQX4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
MYO5CQ9NQX4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
MYO5CQ9NQX4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
MYO5CQ9NQX4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
MYO5CQ9NQX4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
MYO5CQ9NQX4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
MYO5CQ9NQX4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
MYO5CQ9NQX4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
MYO5CQ9NQX4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
MYO5CQ9NQX4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
MYO5CQ9NQX4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC43.37■■■■■ 4.53
MYO5CQ9NQX4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
MYO5CQ9NQX4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
MYO5CQ9NQX4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
MYO5CQ9NQX4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
MYO5CQ9NQX4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
MYO5CQ9NQX4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
MYO5CQ9NQX4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC43.31■■■■■ 4.52
MYO5CQ9NQX4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.28■■■■■ 4.52
MYO5CQ9NQX4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
MYO5CQ9NQX4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
MYO5CQ9NQX4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC43.25■■■■■ 4.51
MYO5CQ9NQX4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
MYO5CQ9NQX4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
MYO5CQ9NQX4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
MYO5CQ9NQX4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
MYO5CQ9NQX4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
MYO5CQ9NQX4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
MYO5CQ9NQX4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
MYO5CQ9NQX4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
MYO5CQ9NQX4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
MYO5CQ9NQX4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
MYO5CQ9NQX4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
MYO5CQ9NQX4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
MYO5CQ9NQX4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
MYO5CQ9NQX4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
MYO5CQ9NQX4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
MYO5CQ9NQX4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
MYO5CQ9NQX4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.07■■■■■ 4.49
MYO5CQ9NQX4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
MYO5CQ9NQX4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
MYO5CQ9NQX4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
MYO5CQ9NQX4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
MYO5CQ9NQX4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
MYO5CQ9NQX4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
MYO5CQ9NQX4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
MYO5CQ9NQX4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.94■■■■■ 4.47
MYO5CQ9NQX4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
MYO5CQ9NQX4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
MYO5CQ9NQX4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
MYO5CQ9NQX4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
MYO5CQ9NQX4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
MYO5CQ9NQX4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
MYO5CQ9NQX4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.46
MYO5CQ9NQX4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
MYO5CQ9NQX4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
MYO5CQ9NQX4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
MYO5CQ9NQX4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
MYO5CQ9NQX4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
MYO5CQ9NQX4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
MYO5CQ9NQX4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.83■■■■■ 4.45
MYO5CQ9NQX4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.44
MYO5CQ9NQX4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.44
MYO5CQ9NQX4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
MYO5CQ9NQX4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
MYO5CQ9NQX4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
MYO5CQ9NQX4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
MYO5CQ9NQX4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
MYO5CQ9NQX4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
MYO5CQ9NQX4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
MYO5CQ9NQX4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
MYO5CQ9NQX4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
MYO5CQ9NQX4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
MYO5CQ9NQX4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
MYO5CQ9NQX4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
MYO5CQ9NQX4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
MYO5CQ9NQX4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
MYO5CQ9NQX4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
MYO5CQ9NQX4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
MYO5CQ9NQX4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
MYO5CQ9NQX4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
MYO5CQ9NQX4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
MYO5CQ9NQX4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
MYO5CQ9NQX4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
MYO5CQ9NQX4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
MYO5CQ9NQX4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
MYO5CQ9NQX4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
MYO5CQ9NQX4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
MYO5CQ9NQX4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
MYO5CQ9NQX4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
MYO5CQ9NQX4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
MYO5CQ9NQX4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.53■■■■■ 4.4
MYO5CQ9NQX4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.53■■■■■ 4.4
MYO5CQ9NQX4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
MYO5CQ9NQX4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
MYO5CQ9NQX4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms