Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NECTIN3Q9NQS3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NECTIN3Q9NQS3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NECTIN3Q9NQS3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NECTIN3Q9NQS3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NECTIN3Q9NQS3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NECTIN3Q9NQS3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NECTIN3Q9NQS3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NECTIN3Q9NQS3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NECTIN3Q9NQS3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NECTIN3Q9NQS3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NECTIN3Q9NQS3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NECTIN3Q9NQS3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NECTIN3Q9NQS3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NECTIN3Q9NQS3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NECTIN3Q9NQS3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NECTIN3Q9NQS3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NECTIN3Q9NQS3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NECTIN3Q9NQS3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NECTIN3Q9NQS3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NECTIN3Q9NQS3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NECTIN3Q9NQS3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN3Q9NQS3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NECTIN3Q9NQS3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NECTIN3Q9NQS3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NECTIN3Q9NQS3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NECTIN3Q9NQS3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NECTIN3Q9NQS3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NECTIN3Q9NQS3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NECTIN3Q9NQS3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NECTIN3Q9NQS3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NECTIN3Q9NQS3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NECTIN3Q9NQS3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NECTIN3Q9NQS3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN3Q9NQS3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NECTIN3Q9NQS3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NECTIN3Q9NQS3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NECTIN3Q9NQS3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NECTIN3Q9NQS3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NECTIN3Q9NQS3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NECTIN3Q9NQS3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NECTIN3Q9NQS3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NECTIN3Q9NQS3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NECTIN3Q9NQS3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NECTIN3Q9NQS3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NECTIN3Q9NQS3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NECTIN3Q9NQS3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NECTIN3Q9NQS3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECTIN3Q9NQS3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NECTIN3Q9NQS3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECTIN3Q9NQS3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECTIN3Q9NQS3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NECTIN3Q9NQS3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN3Q9NQS3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN3Q9NQS3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN3Q9NQS3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN3Q9NQS3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NECTIN3Q9NQS3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NECTIN3Q9NQS3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECTIN3Q9NQS3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NECTIN3Q9NQS3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NECTIN3Q9NQS3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECTIN3Q9NQS3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NECTIN3Q9NQS3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NECTIN3Q9NQS3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN3Q9NQS3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN3Q9NQS3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NECTIN3Q9NQS3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NECTIN3Q9NQS3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NECTIN3Q9NQS3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NECTIN3Q9NQS3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NECTIN3Q9NQS3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NECTIN3Q9NQS3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NECTIN3Q9NQS3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN3Q9NQS3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN3Q9NQS3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NECTIN3Q9NQS3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NECTIN3Q9NQS3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN3Q9NQS3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN3Q9NQS3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NECTIN3Q9NQS3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECTIN3Q9NQS3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECTIN3Q9NQS3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NECTIN3Q9NQS3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN3Q9NQS3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NECTIN3Q9NQS3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECTIN3Q9NQS3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECTIN3Q9NQS3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NECTIN3Q9NQS3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NECTIN3Q9NQS3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN3Q9NQS3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN3Q9NQS3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN3Q9NQS3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN3Q9NQS3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN3Q9NQS3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NECTIN3Q9NQS3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN3Q9NQS3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NECTIN3Q9NQS3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECTIN3Q9NQS3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NECTIN3Q9NQS3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms