Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPRD1BQ9NQG5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPRD1BQ9NQG5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPRD1BQ9NQG5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPRD1BQ9NQG5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPRD1BQ9NQG5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPRD1BQ9NQG5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPRD1BQ9NQG5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPRD1BQ9NQG5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPRD1BQ9NQG5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPRD1BQ9NQG5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPRD1BQ9NQG5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPRD1BQ9NQG5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPRD1BQ9NQG5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPRD1BQ9NQG5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPRD1BQ9NQG5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPRD1BQ9NQG5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPRD1BQ9NQG5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPRD1BQ9NQG5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPRD1BQ9NQG5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPRD1BQ9NQG5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPRD1BQ9NQG5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPRD1BQ9NQG5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPRD1BQ9NQG5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPRD1BQ9NQG5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPRD1BQ9NQG5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPRD1BQ9NQG5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPRD1BQ9NQG5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPRD1BQ9NQG5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPRD1BQ9NQG5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPRD1BQ9NQG5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPRD1BQ9NQG5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPRD1BQ9NQG5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPRD1BQ9NQG5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPRD1BQ9NQG5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPRD1BQ9NQG5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPRD1BQ9NQG5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPRD1BQ9NQG5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPRD1BQ9NQG5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPRD1BQ9NQG5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPRD1BQ9NQG5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPRD1BQ9NQG5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPRD1BQ9NQG5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPRD1BQ9NQG5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPRD1BQ9NQG5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPRD1BQ9NQG5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPRD1BQ9NQG5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPRD1BQ9NQG5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPRD1BQ9NQG5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPRD1BQ9NQG5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPRD1BQ9NQG5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPRD1BQ9NQG5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPRD1BQ9NQG5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPRD1BQ9NQG5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPRD1BQ9NQG5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPRD1BQ9NQG5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPRD1BQ9NQG5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPRD1BQ9NQG5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPRD1BQ9NQG5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPRD1BQ9NQG5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPRD1BQ9NQG5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPRD1BQ9NQG5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPRD1BQ9NQG5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPRD1BQ9NQG5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPRD1BQ9NQG5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPRD1BQ9NQG5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPRD1BQ9NQG5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPRD1BQ9NQG5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPRD1BQ9NQG5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPRD1BQ9NQG5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPRD1BQ9NQG5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPRD1BQ9NQG5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPRD1BQ9NQG5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPRD1BQ9NQG5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPRD1BQ9NQG5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPRD1BQ9NQG5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPRD1BQ9NQG5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPRD1BQ9NQG5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPRD1BQ9NQG5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPRD1BQ9NQG5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPRD1BQ9NQG5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPRD1BQ9NQG5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPRD1BQ9NQG5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPRD1BQ9NQG5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RPRD1BQ9NQG5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPRD1BQ9NQG5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPRD1BQ9NQG5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPRD1BQ9NQG5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPRD1BQ9NQG5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPRD1BQ9NQG5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPRD1BQ9NQG5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPRD1BQ9NQG5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPRD1BQ9NQG5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPRD1BQ9NQG5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPRD1BQ9NQG5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPRD1BQ9NQG5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPRD1BQ9NQG5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPRD1BQ9NQG5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPRD1BQ9NQG5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPRD1BQ9NQG5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms