Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQE9

HINT3, Histidine triad nucleotide-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINT3Q9NQE9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HINT3Q9NQE9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HINT3Q9NQE9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HINT3Q9NQE9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HINT3Q9NQE9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HINT3Q9NQE9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HINT3Q9NQE9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HINT3Q9NQE9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HINT3Q9NQE9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HINT3Q9NQE9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HINT3Q9NQE9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HINT3Q9NQE9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HINT3Q9NQE9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HINT3Q9NQE9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HINT3Q9NQE9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HINT3Q9NQE9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HINT3Q9NQE9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HINT3Q9NQE9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HINT3Q9NQE9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HINT3Q9NQE9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HINT3Q9NQE9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HINT3Q9NQE9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HINT3Q9NQE9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HINT3Q9NQE9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HINT3Q9NQE9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HINT3Q9NQE9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HINT3Q9NQE9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HINT3Q9NQE9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HINT3Q9NQE9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HINT3Q9NQE9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HINT3Q9NQE9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HINT3Q9NQE9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HINT3Q9NQE9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HINT3Q9NQE9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HINT3Q9NQE9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HINT3Q9NQE9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HINT3Q9NQE9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HINT3Q9NQE9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HINT3Q9NQE9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HINT3Q9NQE9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HINT3Q9NQE9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HINT3Q9NQE9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HINT3Q9NQE9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HINT3Q9NQE9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HINT3Q9NQE9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HINT3Q9NQE9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HINT3Q9NQE9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HINT3Q9NQE9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HINT3Q9NQE9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HINT3Q9NQE9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HINT3Q9NQE9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HINT3Q9NQE9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HINT3Q9NQE9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HINT3Q9NQE9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HINT3Q9NQE9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HINT3Q9NQE9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HINT3Q9NQE9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HINT3Q9NQE9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HINT3Q9NQE9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HINT3Q9NQE9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HINT3Q9NQE9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HINT3Q9NQE9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HINT3Q9NQE9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HINT3Q9NQE9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HINT3Q9NQE9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HINT3Q9NQE9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HINT3Q9NQE9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HINT3Q9NQE9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HINT3Q9NQE9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HINT3Q9NQE9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HINT3Q9NQE9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HINT3Q9NQE9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HINT3Q9NQE9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HINT3Q9NQE9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HINT3Q9NQE9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HINT3Q9NQE9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HINT3Q9NQE9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HINT3Q9NQE9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HINT3Q9NQE9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HINT3Q9NQE9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HINT3Q9NQE9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HINT3Q9NQE9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HINT3Q9NQE9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HINT3Q9NQE9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HINT3Q9NQE9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HINT3Q9NQE9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HINT3Q9NQE9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HINT3Q9NQE9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HINT3Q9NQE9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HINT3Q9NQE9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HINT3Q9NQE9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HINT3Q9NQE9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HINT3Q9NQE9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HINT3Q9NQE9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HINT3Q9NQE9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HINT3Q9NQE9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HINT3Q9NQE9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HINT3Q9NQE9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HINT3Q9NQE9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HINT3Q9NQE9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.8 ms