Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD7Q9NPI1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BRD7Q9NPI1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD7Q9NPI1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD7Q9NPI1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BRD7Q9NPI1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD7Q9NPI1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRD7Q9NPI1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRD7Q9NPI1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRD7Q9NPI1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRD7Q9NPI1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRD7Q9NPI1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD7Q9NPI1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD7Q9NPI1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRD7Q9NPI1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD7Q9NPI1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRD7Q9NPI1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRD7Q9NPI1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRD7Q9NPI1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BRD7Q9NPI1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD7Q9NPI1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BRD7Q9NPI1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD7Q9NPI1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BRD7Q9NPI1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD7Q9NPI1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BRD7Q9NPI1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD7Q9NPI1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BRD7Q9NPI1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BRD7Q9NPI1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BRD7Q9NPI1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BRD7Q9NPI1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD7Q9NPI1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD7Q9NPI1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRD7Q9NPI1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD7Q9NPI1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD7Q9NPI1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD7Q9NPI1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRD7Q9NPI1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRD7Q9NPI1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD7Q9NPI1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD7Q9NPI1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD7Q9NPI1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRD7Q9NPI1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD7Q9NPI1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD7Q9NPI1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRD7Q9NPI1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRD7Q9NPI1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD7Q9NPI1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD7Q9NPI1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD7Q9NPI1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD7Q9NPI1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRD7Q9NPI1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRD7Q9NPI1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BRD7Q9NPI1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRD7Q9NPI1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRD7Q9NPI1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BRD7Q9NPI1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BRD7Q9NPI1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD7Q9NPI1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD7Q9NPI1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD7Q9NPI1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BRD7Q9NPI1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD7Q9NPI1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BRD7Q9NPI1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD7Q9NPI1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD7Q9NPI1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRD7Q9NPI1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD7Q9NPI1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD7Q9NPI1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRD7Q9NPI1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD7Q9NPI1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD7Q9NPI1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD7Q9NPI1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRD7Q9NPI1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD7Q9NPI1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRD7Q9NPI1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD7Q9NPI1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD7Q9NPI1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD7Q9NPI1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRD7Q9NPI1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BRD7Q9NPI1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD7Q9NPI1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD7Q9NPI1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BRD7Q9NPI1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRD7Q9NPI1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRD7Q9NPI1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BRD7Q9NPI1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD7Q9NPI1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BRD7Q9NPI1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD7Q9NPI1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BRD7Q9NPI1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD7Q9NPI1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD7Q9NPI1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BRD7Q9NPI1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BRD7Q9NPI1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BRD7Q9NPI1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BRD7Q9NPI1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD7Q9NPI1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD7Q9NPI1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BRD7Q9NPI1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms