Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PALMDQ9NP74 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PALMDQ9NP74 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PALMDQ9NP74 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALMDQ9NP74 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALMDQ9NP74 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALMDQ9NP74 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALMDQ9NP74 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALMDQ9NP74 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALMDQ9NP74 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALMDQ9NP74 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALMDQ9NP74 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALMDQ9NP74 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALMDQ9NP74 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALMDQ9NP74 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALMDQ9NP74 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PALMDQ9NP74 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PALMDQ9NP74 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PALMDQ9NP74 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALMDQ9NP74 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PALMDQ9NP74 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALMDQ9NP74 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PALMDQ9NP74 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PALMDQ9NP74 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PALMDQ9NP74 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PALMDQ9NP74 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALMDQ9NP74 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALMDQ9NP74 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PALMDQ9NP74 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PALMDQ9NP74 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PALMDQ9NP74 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PALMDQ9NP74 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PALMDQ9NP74 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PALMDQ9NP74 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALMDQ9NP74 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PALMDQ9NP74 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PALMDQ9NP74 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PALMDQ9NP74 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALMDQ9NP74 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALMDQ9NP74 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PALMDQ9NP74 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PALMDQ9NP74 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PALMDQ9NP74 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALMDQ9NP74 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PALMDQ9NP74 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALMDQ9NP74 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALMDQ9NP74 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PALMDQ9NP74 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALMDQ9NP74 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PALMDQ9NP74 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PALMDQ9NP74 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALMDQ9NP74 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALMDQ9NP74 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALMDQ9NP74 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PALMDQ9NP74 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALMDQ9NP74 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALMDQ9NP74 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PALMDQ9NP74 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PALMDQ9NP74 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PALMDQ9NP74 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALMDQ9NP74 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALMDQ9NP74 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PALMDQ9NP74 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALMDQ9NP74 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALMDQ9NP74 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALMDQ9NP74 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PALMDQ9NP74 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PALMDQ9NP74 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PALMDQ9NP74 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALMDQ9NP74 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PALMDQ9NP74 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PALMDQ9NP74 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PALMDQ9NP74 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PALMDQ9NP74 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALMDQ9NP74 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALMDQ9NP74 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PALMDQ9NP74 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALMDQ9NP74 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PALMDQ9NP74 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALMDQ9NP74 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALMDQ9NP74 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PALMDQ9NP74 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALMDQ9NP74 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALMDQ9NP74 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PALMDQ9NP74 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PALMDQ9NP74 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PALMDQ9NP74 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALMDQ9NP74 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PALMDQ9NP74 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALMDQ9NP74 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PALMDQ9NP74 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALMDQ9NP74 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALMDQ9NP74 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALMDQ9NP74 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PALMDQ9NP74 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALMDQ9NP74 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PALMDQ9NP74 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PALMDQ9NP74 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PALMDQ9NP74 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PALMDQ9NP74 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms