Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB18Q9NP72 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB18Q9NP72 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB18Q9NP72 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB18Q9NP72 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB18Q9NP72 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB18Q9NP72 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB18Q9NP72 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB18Q9NP72 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB18Q9NP72 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB18Q9NP72 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB18Q9NP72 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB18Q9NP72 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB18Q9NP72 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB18Q9NP72 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB18Q9NP72 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB18Q9NP72 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB18Q9NP72 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB18Q9NP72 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB18Q9NP72 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB18Q9NP72 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB18Q9NP72 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB18Q9NP72 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB18Q9NP72 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB18Q9NP72 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB18Q9NP72 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB18Q9NP72 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB18Q9NP72 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB18Q9NP72 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB18Q9NP72 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB18Q9NP72 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB18Q9NP72 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB18Q9NP72 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAB18Q9NP72 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB18Q9NP72 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAB18Q9NP72 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB18Q9NP72 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAB18Q9NP72 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB18Q9NP72 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB18Q9NP72 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAB18Q9NP72 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB18Q9NP72 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB18Q9NP72 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RAB18Q9NP72 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB18Q9NP72 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RAB18Q9NP72 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB18Q9NP72 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB18Q9NP72 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB18Q9NP72 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB18Q9NP72 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB18Q9NP72 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB18Q9NP72 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB18Q9NP72 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB18Q9NP72 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB18Q9NP72 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB18Q9NP72 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB18Q9NP72 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB18Q9NP72 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB18Q9NP72 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB18Q9NP72 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB18Q9NP72 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB18Q9NP72 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB18Q9NP72 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB18Q9NP72 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB18Q9NP72 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB18Q9NP72 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB18Q9NP72 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB18Q9NP72 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB18Q9NP72 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB18Q9NP72 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB18Q9NP72 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB18Q9NP72 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB18Q9NP72 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB18Q9NP72 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB18Q9NP72 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB18Q9NP72 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB18Q9NP72 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB18Q9NP72 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB18Q9NP72 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB18Q9NP72 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB18Q9NP72 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB18Q9NP72 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB18Q9NP72 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB18Q9NP72 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB18Q9NP72 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB18Q9NP72 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB18Q9NP72 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB18Q9NP72 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB18Q9NP72 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB18Q9NP72 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB18Q9NP72 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB18Q9NP72 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB18Q9NP72 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB18Q9NP72 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB18Q9NP72 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB18Q9NP72 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB18Q9NP72 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB18Q9NP72 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB18Q9NP72 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB18Q9NP72 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms