Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM4

EPB41L5, Band 4.1-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L5Q9HCM4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
EPB41L5Q9HCM4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EPB41L5Q9HCM4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EPB41L5Q9HCM4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EPB41L5Q9HCM4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
EPB41L5Q9HCM4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EPB41L5Q9HCM4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EPB41L5Q9HCM4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EPB41L5Q9HCM4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EPB41L5Q9HCM4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EPB41L5Q9HCM4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EPB41L5Q9HCM4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EPB41L5Q9HCM4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EPB41L5Q9HCM4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EPB41L5Q9HCM4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EPB41L5Q9HCM4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EPB41L5Q9HCM4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EPB41L5Q9HCM4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EPB41L5Q9HCM4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPB41L5Q9HCM4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPB41L5Q9HCM4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EPB41L5Q9HCM4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
EPB41L5Q9HCM4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EPB41L5Q9HCM4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
EPB41L5Q9HCM4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPB41L5Q9HCM4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EPB41L5Q9HCM4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPB41L5Q9HCM4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPB41L5Q9HCM4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPB41L5Q9HCM4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPB41L5Q9HCM4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
EPB41L5Q9HCM4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EPB41L5Q9HCM4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L5Q9HCM4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L5Q9HCM4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPB41L5Q9HCM4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPB41L5Q9HCM4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPB41L5Q9HCM4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EPB41L5Q9HCM4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EPB41L5Q9HCM4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EPB41L5Q9HCM4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EPB41L5Q9HCM4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EPB41L5Q9HCM4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EPB41L5Q9HCM4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EPB41L5Q9HCM4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EPB41L5Q9HCM4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EPB41L5Q9HCM4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EPB41L5Q9HCM4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EPB41L5Q9HCM4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EPB41L5Q9HCM4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EPB41L5Q9HCM4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EPB41L5Q9HCM4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EPB41L5Q9HCM4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPB41L5Q9HCM4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EPB41L5Q9HCM4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EPB41L5Q9HCM4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EPB41L5Q9HCM4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EPB41L5Q9HCM4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EPB41L5Q9HCM4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EPB41L5Q9HCM4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EPB41L5Q9HCM4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EPB41L5Q9HCM4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EPB41L5Q9HCM4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
EPB41L5Q9HCM4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EPB41L5Q9HCM4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EPB41L5Q9HCM4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
EPB41L5Q9HCM4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPB41L5Q9HCM4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EPB41L5Q9HCM4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EPB41L5Q9HCM4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EPB41L5Q9HCM4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EPB41L5Q9HCM4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EPB41L5Q9HCM4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
EPB41L5Q9HCM4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EPB41L5Q9HCM4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
EPB41L5Q9HCM4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EPB41L5Q9HCM4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EPB41L5Q9HCM4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
EPB41L5Q9HCM4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EPB41L5Q9HCM4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EPB41L5Q9HCM4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EPB41L5Q9HCM4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
EPB41L5Q9HCM4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
EPB41L5Q9HCM4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EPB41L5Q9HCM4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EPB41L5Q9HCM4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EPB41L5Q9HCM4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
EPB41L5Q9HCM4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EPB41L5Q9HCM4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EPB41L5Q9HCM4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EPB41L5Q9HCM4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
EPB41L5Q9HCM4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EPB41L5Q9HCM4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EPB41L5Q9HCM4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EPB41L5Q9HCM4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EPB41L5Q9HCM4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EPB41L5Q9HCM4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EPB41L5Q9HCM4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EPB41L5Q9HCM4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EPB41L5Q9HCM4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms