Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PLXNA4Q9HCM2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PLXNA4Q9HCM2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PLXNA4Q9HCM2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PLXNA4Q9HCM2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PLXNA4Q9HCM2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PLXNA4Q9HCM2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PLXNA4Q9HCM2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PLXNA4Q9HCM2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PLXNA4Q9HCM2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PLXNA4Q9HCM2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PLXNA4Q9HCM2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PLXNA4Q9HCM2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PLXNA4Q9HCM2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PLXNA4Q9HCM2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PLXNA4Q9HCM2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PLXNA4Q9HCM2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PLXNA4Q9HCM2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLXNA4Q9HCM2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLXNA4Q9HCM2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PLXNA4Q9HCM2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNA4Q9HCM2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNA4Q9HCM2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNA4Q9HCM2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PLXNA4Q9HCM2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLXNA4Q9HCM2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLXNA4Q9HCM2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
PLXNA4Q9HCM2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PLXNA4Q9HCM2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PLXNA4Q9HCM2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PLXNA4Q9HCM2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PLXNA4Q9HCM2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PLXNA4Q9HCM2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PLXNA4Q9HCM2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PLXNA4Q9HCM2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PLXNA4Q9HCM2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PLXNA4Q9HCM2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PLXNA4Q9HCM2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PLXNA4Q9HCM2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PLXNA4Q9HCM2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLXNA4Q9HCM2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLXNA4Q9HCM2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PLXNA4Q9HCM2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PLXNA4Q9HCM2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PLXNA4Q9HCM2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
PLXNA4Q9HCM2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PLXNA4Q9HCM2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PLXNA4Q9HCM2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PLXNA4Q9HCM2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PLXNA4Q9HCM2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLXNA4Q9HCM2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLXNA4Q9HCM2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PLXNA4Q9HCM2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PLXNA4Q9HCM2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PLXNA4Q9HCM2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PLXNA4Q9HCM2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PLXNA4Q9HCM2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PLXNA4Q9HCM2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLXNA4Q9HCM2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PLXNA4Q9HCM2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PLXNA4Q9HCM2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PLXNA4Q9HCM2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PLXNA4Q9HCM2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PLXNA4Q9HCM2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PLXNA4Q9HCM2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PLXNA4Q9HCM2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PLXNA4Q9HCM2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PLXNA4Q9HCM2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PLXNA4Q9HCM2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
PLXNA4Q9HCM2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PLXNA4Q9HCM2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PLXNA4Q9HCM2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PLXNA4Q9HCM2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNA4Q9HCM2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNA4Q9HCM2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PLXNA4Q9HCM2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNA4Q9HCM2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNA4Q9HCM2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PLXNA4Q9HCM2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLXNA4Q9HCM2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLXNA4Q9HCM2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PLXNA4Q9HCM2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNA4Q9HCM2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PLXNA4Q9HCM2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLXNA4Q9HCM2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PLXNA4Q9HCM2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PLXNA4Q9HCM2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PLXNA4Q9HCM2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PLXNA4Q9HCM2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLXNA4Q9HCM2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PLXNA4Q9HCM2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PLXNA4Q9HCM2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PLXNA4Q9HCM2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PLXNA4Q9HCM2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLXNA4Q9HCM2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLXNA4Q9HCM2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PLXNA4Q9HCM2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms