Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELL3Q9HB65 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELL3Q9HB65 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ELL3Q9HB65 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELL3Q9HB65 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ELL3Q9HB65 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ELL3Q9HB65 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELL3Q9HB65 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ELL3Q9HB65 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ELL3Q9HB65 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ELL3Q9HB65 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELL3Q9HB65 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ELL3Q9HB65 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ELL3Q9HB65 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ELL3Q9HB65 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ELL3Q9HB65 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ELL3Q9HB65 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ELL3Q9HB65 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ELL3Q9HB65 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ELL3Q9HB65 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ELL3Q9HB65 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ELL3Q9HB65 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ELL3Q9HB65 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ELL3Q9HB65 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ELL3Q9HB65 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ELL3Q9HB65 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ELL3Q9HB65 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ELL3Q9HB65 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ELL3Q9HB65 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ELL3Q9HB65 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ELL3Q9HB65 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ELL3Q9HB65 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ELL3Q9HB65 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ELL3Q9HB65 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ELL3Q9HB65 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ELL3Q9HB65 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ELL3Q9HB65 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ELL3Q9HB65 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ELL3Q9HB65 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ELL3Q9HB65 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ELL3Q9HB65 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ELL3Q9HB65 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ELL3Q9HB65 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ELL3Q9HB65 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ELL3Q9HB65 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ELL3Q9HB65 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ELL3Q9HB65 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ELL3Q9HB65 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ELL3Q9HB65 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ELL3Q9HB65 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ELL3Q9HB65 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ELL3Q9HB65 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ELL3Q9HB65 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ELL3Q9HB65 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ELL3Q9HB65 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ELL3Q9HB65 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ELL3Q9HB65 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ELL3Q9HB65 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ELL3Q9HB65 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ELL3Q9HB65 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ELL3Q9HB65 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ELL3Q9HB65 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ELL3Q9HB65 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ELL3Q9HB65 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ELL3Q9HB65 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ELL3Q9HB65 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ELL3Q9HB65 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ELL3Q9HB65 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ELL3Q9HB65 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ELL3Q9HB65 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ELL3Q9HB65 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ELL3Q9HB65 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ELL3Q9HB65 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ELL3Q9HB65 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ELL3Q9HB65 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ELL3Q9HB65 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ELL3Q9HB65 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ELL3Q9HB65 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ELL3Q9HB65 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ELL3Q9HB65 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ELL3Q9HB65 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ELL3Q9HB65 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ELL3Q9HB65 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms