Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EBF2Q9HAK2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EBF2Q9HAK2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
EBF2Q9HAK2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EBF2Q9HAK2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EBF2Q9HAK2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EBF2Q9HAK2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EBF2Q9HAK2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
EBF2Q9HAK2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EBF2Q9HAK2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EBF2Q9HAK2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EBF2Q9HAK2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EBF2Q9HAK2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
EBF2Q9HAK2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EBF2Q9HAK2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EBF2Q9HAK2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EBF2Q9HAK2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EBF2Q9HAK2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EBF2Q9HAK2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EBF2Q9HAK2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EBF2Q9HAK2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EBF2Q9HAK2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EBF2Q9HAK2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EBF2Q9HAK2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EBF2Q9HAK2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EBF2Q9HAK2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EBF2Q9HAK2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EBF2Q9HAK2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EBF2Q9HAK2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EBF2Q9HAK2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EBF2Q9HAK2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EBF2Q9HAK2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EBF2Q9HAK2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EBF2Q9HAK2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EBF2Q9HAK2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EBF2Q9HAK2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
EBF2Q9HAK2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EBF2Q9HAK2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EBF2Q9HAK2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EBF2Q9HAK2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
EBF2Q9HAK2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EBF2Q9HAK2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EBF2Q9HAK2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EBF2Q9HAK2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EBF2Q9HAK2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EBF2Q9HAK2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EBF2Q9HAK2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EBF2Q9HAK2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EBF2Q9HAK2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EBF2Q9HAK2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EBF2Q9HAK2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EBF2Q9HAK2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EBF2Q9HAK2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
EBF2Q9HAK2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EBF2Q9HAK2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EBF2Q9HAK2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EBF2Q9HAK2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EBF2Q9HAK2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EBF2Q9HAK2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EBF2Q9HAK2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EBF2Q9HAK2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EBF2Q9HAK2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EBF2Q9HAK2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EBF2Q9HAK2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EBF2Q9HAK2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EBF2Q9HAK2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EBF2Q9HAK2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EBF2Q9HAK2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EBF2Q9HAK2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EBF2Q9HAK2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
EBF2Q9HAK2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EBF2Q9HAK2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EBF2Q9HAK2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EBF2Q9HAK2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EBF2Q9HAK2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EBF2Q9HAK2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EBF2Q9HAK2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EBF2Q9HAK2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EBF2Q9HAK2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EBF2Q9HAK2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EBF2Q9HAK2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EBF2Q9HAK2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EBF2Q9HAK2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EBF2Q9HAK2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EBF2Q9HAK2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EBF2Q9HAK2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EBF2Q9HAK2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EBF2Q9HAK2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
EBF2Q9HAK2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EBF2Q9HAK2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EBF2Q9HAK2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EBF2Q9HAK2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EBF2Q9HAK2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
EBF2Q9HAK2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EBF2Q9HAK2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EBF2Q9HAK2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EBF2Q9HAK2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EBF2Q9HAK2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EBF2Q9HAK2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EBF2Q9HAK2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms