Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAD4

WDR41, WD repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR41Q9HAD4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR41Q9HAD4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
WDR41Q9HAD4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
WDR41Q9HAD4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
WDR41Q9HAD4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
WDR41Q9HAD4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
WDR41Q9HAD4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
WDR41Q9HAD4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
WDR41Q9HAD4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
WDR41Q9HAD4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
WDR41Q9HAD4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
WDR41Q9HAD4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
WDR41Q9HAD4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
WDR41Q9HAD4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
WDR41Q9HAD4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR41Q9HAD4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
WDR41Q9HAD4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
WDR41Q9HAD4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR41Q9HAD4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
WDR41Q9HAD4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR41Q9HAD4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
WDR41Q9HAD4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR41Q9HAD4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR41Q9HAD4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR41Q9HAD4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
WDR41Q9HAD4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
WDR41Q9HAD4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
WDR41Q9HAD4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WDR41Q9HAD4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR41Q9HAD4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR41Q9HAD4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WDR41Q9HAD4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR41Q9HAD4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
WDR41Q9HAD4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR41Q9HAD4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR41Q9HAD4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR41Q9HAD4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
WDR41Q9HAD4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR41Q9HAD4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WDR41Q9HAD4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
WDR41Q9HAD4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR41Q9HAD4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
WDR41Q9HAD4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WDR41Q9HAD4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR41Q9HAD4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
WDR41Q9HAD4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR41Q9HAD4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR41Q9HAD4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WDR41Q9HAD4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WDR41Q9HAD4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
WDR41Q9HAD4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR41Q9HAD4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WDR41Q9HAD4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR41Q9HAD4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR41Q9HAD4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
WDR41Q9HAD4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR41Q9HAD4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WDR41Q9HAD4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR41Q9HAD4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR41Q9HAD4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR41Q9HAD4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
WDR41Q9HAD4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
WDR41Q9HAD4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
WDR41Q9HAD4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR41Q9HAD4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
WDR41Q9HAD4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WDR41Q9HAD4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR41Q9HAD4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
WDR41Q9HAD4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
WDR41Q9HAD4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
WDR41Q9HAD4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR41Q9HAD4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WDR41Q9HAD4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR41Q9HAD4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR41Q9HAD4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
WDR41Q9HAD4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR41Q9HAD4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
WDR41Q9HAD4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR41Q9HAD4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
WDR41Q9HAD4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
WDR41Q9HAD4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR41Q9HAD4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR41Q9HAD4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
WDR41Q9HAD4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR41Q9HAD4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WDR41Q9HAD4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WDR41Q9HAD4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR41Q9HAD4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
WDR41Q9HAD4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR41Q9HAD4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
WDR41Q9HAD4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR41Q9HAD4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR41Q9HAD4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR41Q9HAD4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WDR41Q9HAD4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR41Q9HAD4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR41Q9HAD4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
WDR41Q9HAD4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR41Q9HAD4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WDR41Q9HAD4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms