Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1BQ9H9Y6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1BQ9H9Y6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1BQ9H9Y6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLR1BQ9H9Y6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1BQ9H9Y6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1BQ9H9Y6 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1BQ9H9Y6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1BQ9H9Y6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1BQ9H9Y6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1BQ9H9Y6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1BQ9H9Y6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1BQ9H9Y6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1BQ9H9Y6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1BQ9H9Y6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1BQ9H9Y6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1BQ9H9Y6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR1BQ9H9Y6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLR1BQ9H9Y6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1BQ9H9Y6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1BQ9H9Y6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1BQ9H9Y6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1BQ9H9Y6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1BQ9H9Y6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1BQ9H9Y6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1BQ9H9Y6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1BQ9H9Y6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1BQ9H9Y6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1BQ9H9Y6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLR1BQ9H9Y6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1BQ9H9Y6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1BQ9H9Y6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1BQ9H9Y6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1BQ9H9Y6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
POLR1BQ9H9Y6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1BQ9H9Y6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
POLR1BQ9H9Y6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1BQ9H9Y6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1BQ9H9Y6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLR1BQ9H9Y6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLR1BQ9H9Y6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLR1BQ9H9Y6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR1BQ9H9Y6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1BQ9H9Y6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1BQ9H9Y6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR1BQ9H9Y6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1BQ9H9Y6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR1BQ9H9Y6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1BQ9H9Y6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR1BQ9H9Y6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR1BQ9H9Y6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1BQ9H9Y6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR1BQ9H9Y6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1BQ9H9Y6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR1BQ9H9Y6 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1BQ9H9Y6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR1BQ9H9Y6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1BQ9H9Y6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1BQ9H9Y6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR1BQ9H9Y6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1BQ9H9Y6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR1BQ9H9Y6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1BQ9H9Y6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
POLR1BQ9H9Y6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1BQ9H9Y6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1BQ9H9Y6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
POLR1BQ9H9Y6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1BQ9H9Y6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
POLR1BQ9H9Y6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1BQ9H9Y6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLR1BQ9H9Y6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLR1BQ9H9Y6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
POLR1BQ9H9Y6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLR1BQ9H9Y6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLR1BQ9H9Y6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLR1BQ9H9Y6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1BQ9H9Y6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1BQ9H9Y6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
POLR1BQ9H9Y6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
POLR1BQ9H9Y6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
POLR1BQ9H9Y6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1BQ9H9Y6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms