Protein–RNA interactions for Protein: Q9H772

GREM2, Gremlin-2, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREM2Q9H772 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
GREM2Q9H772 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
GREM2Q9H772 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
GREM2Q9H772 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
GREM2Q9H772 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
GREM2Q9H772 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
GREM2Q9H772 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
GREM2Q9H772 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
GREM2Q9H772 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
GREM2Q9H772 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
GREM2Q9H772 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GREM2Q9H772 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
GREM2Q9H772 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
GREM2Q9H772 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GREM2Q9H772 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
GREM2Q9H772 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
GREM2Q9H772 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
GREM2Q9H772 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GREM2Q9H772 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
GREM2Q9H772 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
GREM2Q9H772 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
GREM2Q9H772 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
GREM2Q9H772 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GREM2Q9H772 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GREM2Q9H772 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
GREM2Q9H772 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GREM2Q9H772 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GREM2Q9H772 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GREM2Q9H772 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GREM2Q9H772 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GREM2Q9H772 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GREM2Q9H772 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GREM2Q9H772 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
GREM2Q9H772 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GREM2Q9H772 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GREM2Q9H772 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
GREM2Q9H772 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
GREM2Q9H772 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
GREM2Q9H772 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
GREM2Q9H772 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GREM2Q9H772 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
GREM2Q9H772 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
GREM2Q9H772 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
GREM2Q9H772 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GREM2Q9H772 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
GREM2Q9H772 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GREM2Q9H772 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GREM2Q9H772 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
GREM2Q9H772 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GREM2Q9H772 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GREM2Q9H772 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GREM2Q9H772 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GREM2Q9H772 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GREM2Q9H772 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GREM2Q9H772 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
GREM2Q9H772 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GREM2Q9H772 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GREM2Q9H772 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GREM2Q9H772 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GREM2Q9H772 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GREM2Q9H772 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GREM2Q9H772 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GREM2Q9H772 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
GREM2Q9H772 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GREM2Q9H772 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GREM2Q9H772 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
GREM2Q9H772 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GREM2Q9H772 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GREM2Q9H772 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GREM2Q9H772 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GREM2Q9H772 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GREM2Q9H772 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GREM2Q9H772 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GREM2Q9H772 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
GREM2Q9H772 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GREM2Q9H772 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GREM2Q9H772 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GREM2Q9H772 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GREM2Q9H772 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GREM2Q9H772 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GREM2Q9H772 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GREM2Q9H772 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GREM2Q9H772 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GREM2Q9H772 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GREM2Q9H772 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
GREM2Q9H772 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GREM2Q9H772 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GREM2Q9H772 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
GREM2Q9H772 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GREM2Q9H772 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
GREM2Q9H772 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
GREM2Q9H772 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
GREM2Q9H772 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
GREM2Q9H772 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
GREM2Q9H772 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GREM2Q9H772 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
GREM2Q9H772 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
GREM2Q9H772 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
GREM2Q9H772 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GREM2Q9H772 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms