Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
BCAS3Q9H6U6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
BCAS3Q9H6U6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
BCAS3Q9H6U6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
BCAS3Q9H6U6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
BCAS3Q9H6U6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCAS3Q9H6U6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
BCAS3Q9H6U6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
BCAS3Q9H6U6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
BCAS3Q9H6U6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
BCAS3Q9H6U6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
BCAS3Q9H6U6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
BCAS3Q9H6U6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
BCAS3Q9H6U6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
BCAS3Q9H6U6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
BCAS3Q9H6U6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
BCAS3Q9H6U6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
BCAS3Q9H6U6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
BCAS3Q9H6U6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
BCAS3Q9H6U6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
BCAS3Q9H6U6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
BCAS3Q9H6U6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
BCAS3Q9H6U6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
BCAS3Q9H6U6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
BCAS3Q9H6U6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
BCAS3Q9H6U6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
BCAS3Q9H6U6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
BCAS3Q9H6U6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
BCAS3Q9H6U6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
BCAS3Q9H6U6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
BCAS3Q9H6U6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
BCAS3Q9H6U6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
BCAS3Q9H6U6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
BCAS3Q9H6U6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
BCAS3Q9H6U6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
BCAS3Q9H6U6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
BCAS3Q9H6U6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
BCAS3Q9H6U6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
BCAS3Q9H6U6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
BCAS3Q9H6U6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
BCAS3Q9H6U6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
BCAS3Q9H6U6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
BCAS3Q9H6U6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
BCAS3Q9H6U6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
BCAS3Q9H6U6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BCAS3Q9H6U6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BCAS3Q9H6U6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BCAS3Q9H6U6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BCAS3Q9H6U6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
BCAS3Q9H6U6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
BCAS3Q9H6U6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
BCAS3Q9H6U6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
BCAS3Q9H6U6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BCAS3Q9H6U6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
BCAS3Q9H6U6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
BCAS3Q9H6U6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
BCAS3Q9H6U6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
BCAS3Q9H6U6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
BCAS3Q9H6U6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
BCAS3Q9H6U6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
BCAS3Q9H6U6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
BCAS3Q9H6U6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
BCAS3Q9H6U6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BCAS3Q9H6U6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
BCAS3Q9H6U6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BCAS3Q9H6U6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BCAS3Q9H6U6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
BCAS3Q9H6U6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
BCAS3Q9H6U6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BCAS3Q9H6U6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
BCAS3Q9H6U6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
BCAS3Q9H6U6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
BCAS3Q9H6U6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
BCAS3Q9H6U6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BCAS3Q9H6U6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
BCAS3Q9H6U6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
BCAS3Q9H6U6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BCAS3Q9H6U6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
BCAS3Q9H6U6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BCAS3Q9H6U6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
BCAS3Q9H6U6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
BCAS3Q9H6U6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
BCAS3Q9H6U6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
BCAS3Q9H6U6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
BCAS3Q9H6U6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BCAS3Q9H6U6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
BCAS3Q9H6U6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
BCAS3Q9H6U6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BCAS3Q9H6U6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
BCAS3Q9H6U6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BCAS3Q9H6U6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
BCAS3Q9H6U6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
BCAS3Q9H6U6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
BCAS3Q9H6U6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
BCAS3Q9H6U6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
BCAS3Q9H6U6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
BCAS3Q9H6U6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
BCAS3Q9H6U6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
BCAS3Q9H6U6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BCAS3Q9H6U6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms