Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B9

EPHX3, Epoxide hydrolase 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHX3Q9H6B9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
EPHX3Q9H6B9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
EPHX3Q9H6B9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EPHX3Q9H6B9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
EPHX3Q9H6B9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EPHX3Q9H6B9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EPHX3Q9H6B9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EPHX3Q9H6B9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EPHX3Q9H6B9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EPHX3Q9H6B9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EPHX3Q9H6B9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
EPHX3Q9H6B9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EPHX3Q9H6B9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EPHX3Q9H6B9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EPHX3Q9H6B9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EPHX3Q9H6B9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EPHX3Q9H6B9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
EPHX3Q9H6B9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EPHX3Q9H6B9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EPHX3Q9H6B9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EPHX3Q9H6B9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EPHX3Q9H6B9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EPHX3Q9H6B9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EPHX3Q9H6B9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EPHX3Q9H6B9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EPHX3Q9H6B9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EPHX3Q9H6B9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
EPHX3Q9H6B9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
EPHX3Q9H6B9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
EPHX3Q9H6B9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
EPHX3Q9H6B9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EPHX3Q9H6B9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EPHX3Q9H6B9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EPHX3Q9H6B9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EPHX3Q9H6B9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EPHX3Q9H6B9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EPHX3Q9H6B9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EPHX3Q9H6B9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EPHX3Q9H6B9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EPHX3Q9H6B9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EPHX3Q9H6B9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EPHX3Q9H6B9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EPHX3Q9H6B9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
EPHX3Q9H6B9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
EPHX3Q9H6B9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EPHX3Q9H6B9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
EPHX3Q9H6B9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EPHX3Q9H6B9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EPHX3Q9H6B9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EPHX3Q9H6B9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EPHX3Q9H6B9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EPHX3Q9H6B9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EPHX3Q9H6B9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EPHX3Q9H6B9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EPHX3Q9H6B9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EPHX3Q9H6B9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
EPHX3Q9H6B9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
EPHX3Q9H6B9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EPHX3Q9H6B9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EPHX3Q9H6B9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
EPHX3Q9H6B9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EPHX3Q9H6B9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EPHX3Q9H6B9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
EPHX3Q9H6B9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
EPHX3Q9H6B9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EPHX3Q9H6B9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
EPHX3Q9H6B9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
EPHX3Q9H6B9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EPHX3Q9H6B9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EPHX3Q9H6B9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
EPHX3Q9H6B9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EPHX3Q9H6B9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
EPHX3Q9H6B9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EPHX3Q9H6B9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EPHX3Q9H6B9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EPHX3Q9H6B9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EPHX3Q9H6B9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EPHX3Q9H6B9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
EPHX3Q9H6B9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EPHX3Q9H6B9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EPHX3Q9H6B9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
EPHX3Q9H6B9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EPHX3Q9H6B9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EPHX3Q9H6B9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EPHX3Q9H6B9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EPHX3Q9H6B9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPHX3Q9H6B9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPHX3Q9H6B9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EPHX3Q9H6B9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EPHX3Q9H6B9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPHX3Q9H6B9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EPHX3Q9H6B9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EPHX3Q9H6B9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
EPHX3Q9H6B9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EPHX3Q9H6B9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
EPHX3Q9H6B9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EPHX3Q9H6B9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EPHX3Q9H6B9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPHX3Q9H6B9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EPHX3Q9H6B9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms