Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRN3Q9H3W5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRN3Q9H3W5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRN3Q9H3W5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRN3Q9H3W5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRN3Q9H3W5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRN3Q9H3W5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRN3Q9H3W5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRN3Q9H3W5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRN3Q9H3W5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRN3Q9H3W5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRN3Q9H3W5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRN3Q9H3W5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRN3Q9H3W5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRRN3Q9H3W5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LRRN3Q9H3W5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRN3Q9H3W5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRN3Q9H3W5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRN3Q9H3W5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRN3Q9H3W5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRN3Q9H3W5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRN3Q9H3W5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRN3Q9H3W5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRN3Q9H3W5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRN3Q9H3W5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRN3Q9H3W5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRN3Q9H3W5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRN3Q9H3W5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRN3Q9H3W5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRN3Q9H3W5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRN3Q9H3W5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRN3Q9H3W5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRN3Q9H3W5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRN3Q9H3W5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRN3Q9H3W5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRN3Q9H3W5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRN3Q9H3W5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRN3Q9H3W5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRN3Q9H3W5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRN3Q9H3W5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRN3Q9H3W5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRN3Q9H3W5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRN3Q9H3W5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRN3Q9H3W5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRN3Q9H3W5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRN3Q9H3W5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRN3Q9H3W5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRN3Q9H3W5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LRRN3Q9H3W5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRN3Q9H3W5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRN3Q9H3W5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRRN3Q9H3W5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRN3Q9H3W5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRRN3Q9H3W5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRRN3Q9H3W5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRN3Q9H3W5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRN3Q9H3W5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRN3Q9H3W5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRRN3Q9H3W5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRRN3Q9H3W5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRRN3Q9H3W5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRRN3Q9H3W5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRN3Q9H3W5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRN3Q9H3W5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRRN3Q9H3W5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRRN3Q9H3W5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRRN3Q9H3W5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRN3Q9H3W5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRN3Q9H3W5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRN3Q9H3W5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRN3Q9H3W5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRN3Q9H3W5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRN3Q9H3W5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRN3Q9H3W5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRN3Q9H3W5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRN3Q9H3W5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRN3Q9H3W5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRN3Q9H3W5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRN3Q9H3W5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRN3Q9H3W5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRN3Q9H3W5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRN3Q9H3W5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRN3Q9H3W5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRN3Q9H3W5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRN3Q9H3W5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRN3Q9H3W5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRN3Q9H3W5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRN3Q9H3W5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRN3Q9H3W5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRN3Q9H3W5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRN3Q9H3W5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRN3Q9H3W5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRN3Q9H3W5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRN3Q9H3W5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRN3Q9H3W5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRN3Q9H3W5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRN3Q9H3W5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRN3Q9H3W5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRN3Q9H3W5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRN3Q9H3W5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms