Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SEMA4AQ9H3S1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SEMA4AQ9H3S1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SEMA4AQ9H3S1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEMA4AQ9H3S1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SEMA4AQ9H3S1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SEMA4AQ9H3S1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEMA4AQ9H3S1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEMA4AQ9H3S1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SEMA4AQ9H3S1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SEMA4AQ9H3S1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SEMA4AQ9H3S1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SEMA4AQ9H3S1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SEMA4AQ9H3S1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SEMA4AQ9H3S1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SEMA4AQ9H3S1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SEMA4AQ9H3S1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEMA4AQ9H3S1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SEMA4AQ9H3S1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEMA4AQ9H3S1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SEMA4AQ9H3S1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SEMA4AQ9H3S1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SEMA4AQ9H3S1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEMA4AQ9H3S1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEMA4AQ9H3S1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SEMA4AQ9H3S1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEMA4AQ9H3S1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEMA4AQ9H3S1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SEMA4AQ9H3S1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SEMA4AQ9H3S1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SEMA4AQ9H3S1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEMA4AQ9H3S1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SEMA4AQ9H3S1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SEMA4AQ9H3S1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEMA4AQ9H3S1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SEMA4AQ9H3S1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEMA4AQ9H3S1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEMA4AQ9H3S1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEMA4AQ9H3S1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEMA4AQ9H3S1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEMA4AQ9H3S1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEMA4AQ9H3S1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEMA4AQ9H3S1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEMA4AQ9H3S1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEMA4AQ9H3S1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEMA4AQ9H3S1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEMA4AQ9H3S1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEMA4AQ9H3S1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEMA4AQ9H3S1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEMA4AQ9H3S1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SEMA4AQ9H3S1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEMA4AQ9H3S1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEMA4AQ9H3S1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEMA4AQ9H3S1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEMA4AQ9H3S1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEMA4AQ9H3S1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEMA4AQ9H3S1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEMA4AQ9H3S1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEMA4AQ9H3S1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEMA4AQ9H3S1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA4AQ9H3S1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA4AQ9H3S1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEMA4AQ9H3S1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA4AQ9H3S1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA4AQ9H3S1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEMA4AQ9H3S1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEMA4AQ9H3S1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEMA4AQ9H3S1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEMA4AQ9H3S1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SEMA4AQ9H3S1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA4AQ9H3S1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SEMA4AQ9H3S1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SEMA4AQ9H3S1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SEMA4AQ9H3S1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SEMA4AQ9H3S1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SEMA4AQ9H3S1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA4AQ9H3S1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA4AQ9H3S1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA4AQ9H3S1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA4AQ9H3S1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SEMA4AQ9H3S1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA4AQ9H3S1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA4AQ9H3S1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SEMA4AQ9H3S1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SEMA4AQ9H3S1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA4AQ9H3S1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SEMA4AQ9H3S1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA4AQ9H3S1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA4AQ9H3S1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA4AQ9H3S1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SEMA4AQ9H3S1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEMA4AQ9H3S1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEMA4AQ9H3S1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SEMA4AQ9H3S1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SEMA4AQ9H3S1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SEMA4AQ9H3S1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA4AQ9H3S1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SEMA4AQ9H3S1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA4AQ9H3S1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SEMA4AQ9H3S1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms