Protein–RNA interactions for Protein: Q9H257

CARD9, Caspase recruitment domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD9Q9H257 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CARD9Q9H257 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CARD9Q9H257 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD9Q9H257 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CARD9Q9H257 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CARD9Q9H257 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CARD9Q9H257 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CARD9Q9H257 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CARD9Q9H257 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CARD9Q9H257 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARD9Q9H257 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARD9Q9H257 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CARD9Q9H257 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD9Q9H257 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CARD9Q9H257 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARD9Q9H257 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARD9Q9H257 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CARD9Q9H257 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CARD9Q9H257 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CARD9Q9H257 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARD9Q9H257 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARD9Q9H257 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CARD9Q9H257 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CARD9Q9H257 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARD9Q9H257 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CARD9Q9H257 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CARD9Q9H257 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CARD9Q9H257 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARD9Q9H257 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARD9Q9H257 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CARD9Q9H257 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CARD9Q9H257 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CARD9Q9H257 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CARD9Q9H257 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CARD9Q9H257 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARD9Q9H257 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CARD9Q9H257 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CARD9Q9H257 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARD9Q9H257 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARD9Q9H257 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARD9Q9H257 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARD9Q9H257 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARD9Q9H257 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARD9Q9H257 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARD9Q9H257 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CARD9Q9H257 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARD9Q9H257 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARD9Q9H257 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARD9Q9H257 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARD9Q9H257 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARD9Q9H257 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARD9Q9H257 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARD9Q9H257 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARD9Q9H257 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARD9Q9H257 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARD9Q9H257 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARD9Q9H257 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARD9Q9H257 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARD9Q9H257 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARD9Q9H257 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARD9Q9H257 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARD9Q9H257 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARD9Q9H257 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARD9Q9H257 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARD9Q9H257 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARD9Q9H257 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CARD9Q9H257 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CARD9Q9H257 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARD9Q9H257 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARD9Q9H257 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CARD9Q9H257 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CARD9Q9H257 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CARD9Q9H257 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CARD9Q9H257 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CARD9Q9H257 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CARD9Q9H257 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CARD9Q9H257 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARD9Q9H257 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CARD9Q9H257 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CARD9Q9H257 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARD9Q9H257 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARD9Q9H257 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CARD9Q9H257 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CARD9Q9H257 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARD9Q9H257 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CARD9Q9H257 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CARD9Q9H257 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CARD9Q9H257 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CARD9Q9H257 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CARD9Q9H257 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARD9Q9H257 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CARD9Q9H257 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARD9Q9H257 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CARD9Q9H257 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARD9Q9H257 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CARD9Q9H257 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARD9Q9H257 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CARD9Q9H257 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARD9Q9H257 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CARD9Q9H257 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms