Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
NBPF3Q9H094 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NBPF3Q9H094 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
NBPF3Q9H094 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NBPF3Q9H094 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NBPF3Q9H094 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NBPF3Q9H094 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NBPF3Q9H094 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NBPF3Q9H094 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NBPF3Q9H094 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NBPF3Q9H094 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NBPF3Q9H094 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NBPF3Q9H094 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF3Q9H094 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NBPF3Q9H094 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NBPF3Q9H094 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NBPF3Q9H094 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NBPF3Q9H094 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NBPF3Q9H094 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NBPF3Q9H094 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NBPF3Q9H094 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NBPF3Q9H094 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NBPF3Q9H094 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NBPF3Q9H094 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NBPF3Q9H094 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NBPF3Q9H094 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NBPF3Q9H094 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NBPF3Q9H094 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NBPF3Q9H094 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NBPF3Q9H094 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NBPF3Q9H094 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NBPF3Q9H094 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NBPF3Q9H094 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NBPF3Q9H094 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NBPF3Q9H094 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NBPF3Q9H094 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
NBPF3Q9H094 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NBPF3Q9H094 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NBPF3Q9H094 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NBPF3Q9H094 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NBPF3Q9H094 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NBPF3Q9H094 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NBPF3Q9H094 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NBPF3Q9H094 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NBPF3Q9H094 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NBPF3Q9H094 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NBPF3Q9H094 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NBPF3Q9H094 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
NBPF3Q9H094 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NBPF3Q9H094 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NBPF3Q9H094 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
NBPF3Q9H094 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NBPF3Q9H094 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NBPF3Q9H094 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
NBPF3Q9H094 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NBPF3Q9H094 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NBPF3Q9H094 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NBPF3Q9H094 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NBPF3Q9H094 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NBPF3Q9H094 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NBPF3Q9H094 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NBPF3Q9H094 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NBPF3Q9H094 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NBPF3Q9H094 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
NBPF3Q9H094 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NBPF3Q9H094 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NBPF3Q9H094 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NBPF3Q9H094 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NBPF3Q9H094 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NBPF3Q9H094 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NBPF3Q9H094 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NBPF3Q9H094 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NBPF3Q9H094 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NBPF3Q9H094 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NBPF3Q9H094 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NBPF3Q9H094 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NBPF3Q9H094 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NBPF3Q9H094 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NBPF3Q9H094 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NBPF3Q9H094 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NBPF3Q9H094 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NBPF3Q9H094 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
NBPF3Q9H094 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NBPF3Q9H094 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NBPF3Q9H094 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
NBPF3Q9H094 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NBPF3Q9H094 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NBPF3Q9H094 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
NBPF3Q9H094 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NBPF3Q9H094 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NBPF3Q9H094 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NBPF3Q9H094 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NBPF3Q9H094 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NBPF3Q9H094 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NBPF3Q9H094 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NBPF3Q9H094 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NBPF3Q9H094 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NBPF3Q9H094 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NBPF3Q9H094 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NBPF3Q9H094 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms