Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LNPKQ9C0E8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LNPKQ9C0E8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LNPKQ9C0E8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LNPKQ9C0E8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LNPKQ9C0E8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LNPKQ9C0E8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LNPKQ9C0E8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
LNPKQ9C0E8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LNPKQ9C0E8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LNPKQ9C0E8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LNPKQ9C0E8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LNPKQ9C0E8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LNPKQ9C0E8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LNPKQ9C0E8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LNPKQ9C0E8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LNPKQ9C0E8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LNPKQ9C0E8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LNPKQ9C0E8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LNPKQ9C0E8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LNPKQ9C0E8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LNPKQ9C0E8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LNPKQ9C0E8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LNPKQ9C0E8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LNPKQ9C0E8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LNPKQ9C0E8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
LNPKQ9C0E8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
LNPKQ9C0E8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LNPKQ9C0E8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LNPKQ9C0E8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LNPKQ9C0E8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LNPKQ9C0E8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LNPKQ9C0E8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LNPKQ9C0E8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LNPKQ9C0E8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LNPKQ9C0E8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LNPKQ9C0E8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
LNPKQ9C0E8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LNPKQ9C0E8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LNPKQ9C0E8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LNPKQ9C0E8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LNPKQ9C0E8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
LNPKQ9C0E8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LNPKQ9C0E8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LNPKQ9C0E8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
LNPKQ9C0E8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LNPKQ9C0E8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LNPKQ9C0E8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LNPKQ9C0E8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LNPKQ9C0E8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
LNPKQ9C0E8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LNPKQ9C0E8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LNPKQ9C0E8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
LNPKQ9C0E8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
LNPKQ9C0E8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
LNPKQ9C0E8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
LNPKQ9C0E8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
LNPKQ9C0E8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
LNPKQ9C0E8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
LNPKQ9C0E8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
LNPKQ9C0E8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
LNPKQ9C0E8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LNPKQ9C0E8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LNPKQ9C0E8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
LNPKQ9C0E8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
LNPKQ9C0E8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
LNPKQ9C0E8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
LNPKQ9C0E8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LNPKQ9C0E8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LNPKQ9C0E8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
LNPKQ9C0E8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LNPKQ9C0E8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
LNPKQ9C0E8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
LNPKQ9C0E8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
LNPKQ9C0E8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
LNPKQ9C0E8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
LNPKQ9C0E8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LNPKQ9C0E8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
LNPKQ9C0E8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
LNPKQ9C0E8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
LNPKQ9C0E8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
LNPKQ9C0E8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
LNPKQ9C0E8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
LNPKQ9C0E8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
LNPKQ9C0E8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
LNPKQ9C0E8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
LNPKQ9C0E8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LNPKQ9C0E8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
LNPKQ9C0E8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LNPKQ9C0E8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
LNPKQ9C0E8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
LNPKQ9C0E8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
LNPKQ9C0E8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
LNPKQ9C0E8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
LNPKQ9C0E8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
LNPKQ9C0E8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
LNPKQ9C0E8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LNPKQ9C0E8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LNPKQ9C0E8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
LNPKQ9C0E8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms