Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIM8Q9BZR9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM8Q9BZR9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM8Q9BZR9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM8Q9BZR9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM8Q9BZR9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM8Q9BZR9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM8Q9BZR9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM8Q9BZR9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM8Q9BZR9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM8Q9BZR9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM8Q9BZR9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM8Q9BZR9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM8Q9BZR9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM8Q9BZR9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM8Q9BZR9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM8Q9BZR9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM8Q9BZR9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM8Q9BZR9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM8Q9BZR9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM8Q9BZR9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM8Q9BZR9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM8Q9BZR9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM8Q9BZR9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM8Q9BZR9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM8Q9BZR9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM8Q9BZR9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM8Q9BZR9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM8Q9BZR9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM8Q9BZR9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM8Q9BZR9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM8Q9BZR9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM8Q9BZR9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM8Q9BZR9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM8Q9BZR9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM8Q9BZR9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM8Q9BZR9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM8Q9BZR9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM8Q9BZR9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM8Q9BZR9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM8Q9BZR9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM8Q9BZR9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM8Q9BZR9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM8Q9BZR9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM8Q9BZR9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM8Q9BZR9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM8Q9BZR9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM8Q9BZR9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM8Q9BZR9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM8Q9BZR9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM8Q9BZR9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM8Q9BZR9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM8Q9BZR9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM8Q9BZR9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM8Q9BZR9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM8Q9BZR9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM8Q9BZR9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM8Q9BZR9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM8Q9BZR9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM8Q9BZR9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM8Q9BZR9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM8Q9BZR9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM8Q9BZR9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM8Q9BZR9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM8Q9BZR9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM8Q9BZR9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM8Q9BZR9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM8Q9BZR9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM8Q9BZR9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM8Q9BZR9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM8Q9BZR9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM8Q9BZR9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRIM8Q9BZR9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM8Q9BZR9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM8Q9BZR9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM8Q9BZR9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRIM8Q9BZR9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM8Q9BZR9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM8Q9BZR9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRIM8Q9BZR9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM8Q9BZR9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM8Q9BZR9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM8Q9BZR9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM8Q9BZR9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM8Q9BZR9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM8Q9BZR9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM8Q9BZR9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM8Q9BZR9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM8Q9BZR9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM8Q9BZR9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM8Q9BZR9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM8Q9BZR9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRIM8Q9BZR9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TRIM8Q9BZR9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM8Q9BZR9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM8Q9BZR9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRIM8Q9BZR9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRIM8Q9BZR9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM8Q9BZR9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRIM8Q9BZR9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms